Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A08
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  123748673

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  338  of  373  ( 44737 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
113161879--113161925
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1.12
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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T
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51
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2.3
23
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29
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
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C
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15
27
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1.96
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2.0
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20
1.92
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2.2
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1.34
Indices
Period
Size
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Number
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Size
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Score
A
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(0-2)
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177
2.7
177
88
2
675
29
16
26
27
1.97
113325204--113325347
44
3.3
43
72
11
121
29
20
25
24
1.99
113325211--113325375
89
1.9
89
81
0
195
31
20
22
25
1.98
113325362--113325423
31
2.0
31
83
0
79
25
16
25
32
1.96
113325296--113325642
130
2.8
122
85
6
423
30
19
23
26
1.98
113327337--113327368
12
2.7
12
95
0
55
25
3
6
65
1.31
113328685--113328739
27
1.9
30
82
10
71
70
5
20
3
1.22
113329993--113330026
16
2.1
16
88
0
50
35
0
23
41
1.55
113330215--113330301
21
4.0
23
77
11
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16
21
24
37
1.93
113330227--113330276
21
2.3
22
93
6
84
12
26
28
34
1.92
113332388--113332431
21
2.1
21
95
0
79
52
18
2
27
1.57
113337384--113337455
36
2.1
36
82
12
89
58
9
13
18
1.62
113343372--113343462
23
4.0
24
80
11
91
18
25
17
38
1.92
113343376--113343477
23
4.5
23
67
15
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19
24
17
38
1.93
113350547--113350715
48
3.5
48
80
0
212
28
26
17
28
1.97
113350538--113350716
96
1.9
96
91
0
295
27
25
17
29
1.97
113356698--113356817
40
3.0
40
85
4
145
36
15
9
38
1.80
113358768--113358814
25
2.0
25
83
8
62
27
14
4
53
1.60
113359075--113359256
46
4.0
46
87
1
222
20
24
14
40
1.90
113361920--113361946
14
1.9
14
100
0
54
85
0
7
7
0.75
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
113363547--113363617
6
11.5
6
78
11
63
43
0
0
56
0.99
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25
1.9
25
95
0
87
43
0
0
56
0.99
113363547--113363617
25
2.9
25
77
10
83
43
0
0
56
0.99
113363585--113363626
18
2.4
17
84
11
57
52
0
0
47
1.00
113379849--113379906
16
3.2
18
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13
66
27
0
3
68
1.05
113379843--113379907
19
3.5
18
76
19
71
27
0
3
69
1.03
113384113--113384195
42
2.0
42
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0
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46
20
18
14
1.83
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13
2.1
13
100
0
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7
0
70
1.12
113388846--113388951
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1.9
55
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3
160
51
12
6
29
1.64
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31
2.0
32
84
9
85
47
0
4
47
1.23
113393245--113393302
15
3.8
15
80
11
55
72
5
18
3
1.18
113394875--113394899
12
2.1
12
100
0
50
16
24
20
40
1.91
113394934--113395046
47
2.4
47
89
1
163
16
20
22
40
1.91
113395174--113395259
18
4.7
18
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1
100
36
9
11
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1.73
113395171--113395259
36
2.4
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1
126
35
10
12
41
1.76
113400490--113400541
24
2.2
24
89
0
77
55
9
1
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1.43
113402460--113402511
24
2.2
24
89
0
77
55
9
1
32
1.43
113409799--113409867
35
1.9
36
82
8
88
52
8
0
39
1.33
113422637--113422693
30
1.9
30
89
7
89
22
8
17
50
1.73
113425519--113425550
3
10.7
3
93
0
55
65
0
3
31
1.08
113425746--113425820
24
3.0
24
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15
71
61
4
4
30
1.33
113425747--113425840
26
3.7
26
76
4
95
60
4
4
30
1.35
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
113426154--113426200
18
2.6
18
80
6
60
68
0
2
29
1.02
113426192--113426220
12
2.4
12
100
0
58
51
0
13
34
1.42
113426364--113426398
3
11.7
3
87
0
52
62
5
0
31
1.18
113426616--113426684
25
2.7
25
77
16
70
55
7
4
33
1.47
113426676--113426748
3
25.0
3
86
8
89
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1
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1.19
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10
4.7
10
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26
0
2
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0.98
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1
1
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28
2.7
28
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2
1
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1.18
113428091--113428151
20
3.2
18
77
11
52
34
1
4
59
1.29
113428038--113428144
20
5.2
20
71
19
69
37
1
3
57
1.28

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          369   370   371   372   373