Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A08
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  123748673

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  11  of  373  ( 44737 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
3226435--3226533
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0
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0.62
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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2.3
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29
0
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60
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148
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12
21
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451
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16
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1.94
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5.2
73
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441
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1.80
3289763--3289870
52
2.1
52
96
0
198
33
6
23
37
1.80
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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22
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5.9
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0
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29
20
28
1.98
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2.4
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226
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29
19
28
1.98
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19
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2
69
1.02
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
3359519--3359598
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3
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1.22
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12.1
47
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31
9
30
28
1.88
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37
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17
29
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17
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25
1.99
3379057--3379428
123
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125
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9
380
29
22
20
26
1.99
3379722--3379766
21
2.1
21
100
0
90
0
57
17
24
1.40
3380324--3380361
19
2.1
18
85
9
51
52
0
7
39
1.31
3385896--3385973
29
2.7
28
84
11
104
25
14
30
29
1.94
3385926--3386253
174
1.9
174
96
0
611
29
14
24
31
1.94
3389267--3389306
21
1.9
21
94
0
71
47
12
10
30
1.74
3391255--3391771
133
3.9
133
99
0
1018
51
18
9
20
1.74
3395770--3396142
41
9.1
40
88
3
476
18
22
23
34
1.96
3396591--3396634
23
2.0
22
86
4
61
45
13
20
20
1.85
3400139--3400532
27
14.6
27
84
1
468
40
20
7
31
1.80
3400139--3400532
54
7.3
54
88
0
547
40
20
7
31
1.80
3400139--3400591
81
5.6
80
77
4
419
40
20
8
31
1.82
3400139--3400587
27
16.7
27
78
6
344
40
20
8
30
1.81
3400222--3400640
27
15.6
27
78
5
118
39
21
8
31
1.83
3400625--3400706
27
3.1
27
91
1
130
35
20
20
23
1.96
3402787--3402832
16
2.9
16
78
15
51
78
4
2
15
1.01
3402524--3403038
281
1.8
281
91
0
843
51
11
9
27
1.69
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
3403407--3403487
19
4.2
19
93
3
135
35
9
18
35
1.84
3409885--3410592
44
16.1
44
74
9
559
32
17
22
26
1.97
3409877--3410595
132
5.4
132
93
0
1186
32
17
22
27
1.97
3411163--3411241
19
4.2
19
90
9
126
37
10
16
35
1.82
3411153--3411240
36
2.4
36
80
17
119
38
10
15
35
1.82
3414270--3414309
12
3.3
12
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0
71
7
27
42
22
1.80
3424658--3424899
44
5.5
44
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2
342
31
14
28
25
1.95
3424674--3424993
132
2.4
132
81
6
346
29
15
28
26
1.96
3426457--3426506
12
3.9
13
79
10
59
34
2
0
64
1.05
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21
2.2
21
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7
67
34
4
0
60
1.16
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19
1.9
19
88
0
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35
5
2
56
1.36
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71
2.3
67
84
9
199
30
6
12
51
1.64
3445238--3445309
23
3.2
23
67
21
71
25
16
27
30
1.97
3445021--3445774
44
17.1
44
87
1
1030
31
14
26
26
1.95
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21
2.6
21
77
11
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35
3
0
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1.14
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71
2.3
69
84
9
203
29
6
12
51
1.63
3457028--3457065
5
7.8
5
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5
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18
0
0
81
0.69
3457028--3457065
14
2.6
15
91
8
69
18
0
0
81
0.69
3457028--3457064
19
1.9
19
100
0
74
18
0
0
81
0.70
3468821--3468863
19
2.4
19
88
7
63
37
13
11
37
1.82
3468829--3468865
19
1.9
19
100
0
74
37
10
16
35
1.83
3468829--3468888
19
2.8
22
85
9
72
36
8
16
38
1.79
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
3469869--3469921
22
2.4
22
87
6
72
64
3
5
26
1.33
3495744--3495905
89
1.8
87
80
5
191
31
18
23
26
1.97
3495408--3495996
219
2.7
220
91
0
937
32
18
22
27
1.97
3495959--3496309
78
4.5
78
89
2
553
32
19
25
23
1.98
3495938--3496309
156
2.4
156
94
0
645
31
19
24
24
1.98
3495792--3496656
443
2.0
442
89
2
1333
32
18
23
25
1.97
3496016--3496791
365
2.1
368
87
2
1103
32
18
23
25
1.97
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78
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33
18
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1.97
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44
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32
14
28
24
1.94
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89
1.9
89
90
0
266
30
13
29
26
1.94

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          369   370   371   372   373