Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A08
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  123748673

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  345  of  373  ( 44737 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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100
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15
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Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
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Score
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0
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1.57
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Percent
Indels
Score
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Period
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A
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(0-2)
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90
10
62
61
7
0
30
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2.0
19
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10
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50
7
13
28
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20
2.1
21
83
4
54
13
13
2
70
1.26
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100
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0
0
66
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18
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74
54
0
2
43
1.12
115465953--115466000
10
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0
2
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1.12
115466359--115466402
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52
0
0
47
1.00
115466379--115466422
18
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19
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0
0
40
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115466640--115466784
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2.0
73
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115468622--115468700
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31
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30
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0
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2.0
21
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0
59
58
4
11
25
1.52
115484637--115484760
36
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35
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23
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5
25
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115484679--115484796
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115484650--115484794
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0
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8
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1.48
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2.0
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0
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22
2.0
22
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0
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2.1
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95
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36
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12
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10
4.4
10
88
2
61
79
0
11
9
0.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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73
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29
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16
37
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14
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0
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0
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2
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1.38
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2.0
32
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12
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7
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0
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24
0
0
75
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0
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1.20
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0
0
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1.9
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2
2
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0
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2.8
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12
52
35
0
0
64
0.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
115535338--115535389
21
2.4
21
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1
1
59
1.19
115535334--115535392
21
2.9
21
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1
1
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1.20
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2
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2.8
24
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2
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0.97
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0
0
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0
0
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0
0
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36
0
3
59
1.15

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          369   370   371   372   373