Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A08
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  123748673

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  121  of  373  ( 44737 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
39571836--39572164
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2.2
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1.99
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2.2
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200
25
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24
1.99
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4.3
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231
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1.99
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3.2
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21
25
15
1.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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27
6.6
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288
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1.94
39691071--39691250
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18
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25
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25
1.81
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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Entropy
(0-2)
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52
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20
27
29
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
39782137--39782364
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4.9
48
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28
24
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26
1.99
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45
78
8
199
22
29
20
28
1.98
39791435--39791644
94
2.3
92
80
10
234
22
29
20
28
1.98
39791375--39791654
46
6.0
47
74
14
181
23
27
20
28
1.99
39793734--39793854
43
2.8
42
77
12
120
33
25
16
23
1.96
39797863--39797986
59
2.1
60
92
3
207
41
3
12
41
1.59
39798583--39798621
16
2.4
17
83
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55
51
0
0
48
1.00
39800926--39801058
58
2.2
59
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171
44
0
6
49
1.27
39809168--39809258
44
2.1
44
95
0
164
31
24
12
31
1.92
39813960--39814091
55
2.4
55
81
10
148
31
25
28
14
1.95
39817216--39817281
33
2.0
33
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0
123
21
16
16
45
1.85
39817294--39817324
4
7.8
4
100
0
62
51
22
0
25
1.48
39821148--39821200
26
2.0
26
96
0
97
45
9
3
41
1.54
39824687--39824733
20
2.3
20
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0
58
27
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8
55
1.59
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17
2.0
17
100
0
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1.9
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45
0
2
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1.13
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17
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31
0
0
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0.90
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36
2.4
35
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33
3
2
60
1.27
39829458--39829491
17
2.0
17
100
0
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41
11
5
41
1.66
39829442--39829467
5
5.2
5
100
0
52
38
23
0
38
1.55
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.1
44
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0
103
46
13
17
22
1.82
39830466--39830536
22
3.2
22
76
4
63
43
14
15
26
1.85
39831179--39831323
63
2.3
63
82
3
186
26
26
20
26
1.99
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46
3.8
46
76
12
189
21
20
27
30
1.98
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93
1.8
93
92
0
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21
21
28
29
1.98
39848380--39848472
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2.0
47
97
0
177
24
30
8
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1.86
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3.3
59
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1
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1.96
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2.3
11
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0
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1.9
51
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0
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44
17
12
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1.83
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24
24
26
24
2.00
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2.3
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83
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23
22
28
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1.99
39875272--39875456
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4.7
40
82
9
211
23
22
28
25
1.99
39875325--39875479
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2.0
78
82
10
190
25
20
28
25
1.99
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20
2.5
20
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0
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35
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1.88
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2.7
28
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25
15
30
28
1.96
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1.9
174
97
0
620
30
14
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1.95
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2.0
32
93
0
108
23
4
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4.5
50
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9
228
25
17
26
30
1.97
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101
2.4
98
81
4
266
25
17
27
30
1.97
39893959--39894010
27
2.0
26
81
11
61
38
1
23
36
1.66
39901132--39901306
50
3.5
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244
24
17
28
30
1.97
39901128--39901318
99
1.9
100
91
1
312
24
17
28
29
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
39901407--39901458
27
2.0
26
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11
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38
1
23
36
1.66
39904360--39904443
23
3.5
24
77
9
73
26
21
19
33
1.97
39904397--39904453
25
2.3
25
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6
71
28
22
19
29
1.98
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20
2.0
20
85
0
53
42
17
20
20
1.89
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2.1
19
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45
2
0
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1.13
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2.0
25
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2
2
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1.21
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2.4
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13
102
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2
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2.0
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2.3
81
83
9
225
23
22
28
25
1.99
39920586--39920770
40
4.7
40
82
9
211
23
22
28
25
1.99

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          369   370   371   372   373