Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A08
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  123748673

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  367  of  373  ( 44737 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
121343014--121343121
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19
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2.0
25
92
0
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17
5
39
1.74
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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11
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2.0
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2.2
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0
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2.4
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64
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26
1.22
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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Entropy
(0-2)
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2.0
23
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2.2
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1
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1.13
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19
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19
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0
56
48
0
2
48
1.15
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
121561790--121561847
24
2.6
22
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66
50
0
1
48
1.11
121561814--121561876
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2.5
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0
1
49
1.10
121561799--121561847
24
2.0
24
88
8
71
48
0
2
48
1.12
121562304--121562356
22
2.5
21
77
19
56
30
1
0
67
1.01
121563729--121563763
18
2.0
18
88
5
54
68
0
11
20
1.20
121567984--121568346
180
2.0
181
92
2
602
34
18
14
31
1.91
121569076--121569111
16
2.2
16
90
9
56
69
16
11
2
1.29
121576922--121576953
10
3.3
10
95
4
57
31
6
0
62
1.20
121577663--121577700
17
2.1
19
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26
13
5
55
1.59
121579773--121579797
3
8.3
3
100
0
50
0
0
68
32
0.90
121582134--121582418
46
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47
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20
21
14
43
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121582168--121582242
24
3.2
24
60
17
57
18
22
16
42
1.88
121582104--121582386
92
3.1
93
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3
351
20
20
14
44
1.86
121582394--121582445
27
1.9
27
92
0
86
21
23
15
40
1.91
121582302--121582520
119
1.8
119
94
0
384
24
24
12
37
1.91
121582348--121582491
73
2.0
73
95
0
261
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23
13
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1.90
121582418--121582520
46
2.2
46
92
0
179
24
25
13
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1.92
121586560--121586615
27
2.1
27
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0
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37
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17
35
1.82
121590452--121590483
15
2.1
15
100
0
64
18
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6
68
1.32
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16
2.8
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10
50
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0
0
60
0.96
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19
2.4
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12
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38
2
0
59
1.09
121594162--121594208
22
2.1
22
84
7
60
34
4
14
46
1.64
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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11
100
0
50
24
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0
68
1.16
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30
2.3
29
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5
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48
10
13
27
1.74
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2.1
16
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0
59
17
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5
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1.66
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30
2.1
31
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8
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3
28
1.44
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22
2.0
22
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0
59
58
11
11
18
1.63
121607301--121607341
11
3.7
11
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0
55
56
9
14
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1.66
121607302--121607351
22
2.3
22
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66
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6
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1.63
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2.0
20
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2
0
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1.12
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2
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1.32
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2.1
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1
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40
1.36
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1.9
31
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3
100
46
3
5
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1.42
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2.0
45
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130
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20
2.1
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53
47
0
10
42
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20
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0
0
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15
3.2
15
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14
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63
0
0
36
0.94
121637204--121637255
7
7.4
7
77
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0
0
38
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2.0
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0
0
61
0.96
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22
5.0
21
74
21
77
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2
0
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1.18
121641743--121641861
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38
2
0
57
1.18
121646000--121646220
106
2.1
107
95
1
401
32
15
13
39
1.86
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
121648153--121648261
53
2.1
53
100
0
218
3
19
20
56
1.56
121648180--121648263
27
3.1
27
61
16
66
4
22
17
54
1.61
121660508--121660953
173
2.5
177
80
8
482
24
15
21
38
1.92
121662898--121663149
120
2.1
120
83
1
317
17
28
27
26
1.98
121663019--121663665
132
4.9
132
78
8
554
17
27
27
27
1.98
121663185--121663665
252
1.9
252
85
1
669
17
28
27
26
1.98
121666427--121666478
22
2.3
22
90
3
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1
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121666427--121666471
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2
17
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1.61
121669459--121669503
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2.0
22
91
0
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2
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13
2.8
14
84
16
51
27
25
0
47
1.52

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          369   370   371   372   373