Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A08
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  123748673

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  282  of  373  ( 44737 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Percent
Indels
Score
A
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1.98
Indices
Period
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Period
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Score
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Indices
Period
Size
Copy
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Percent
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Percent
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Score
A
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17
100
0
68
41
17
5
35
1.74
95954418--95954464
21
2.2
21
88
0
67
38
0
19
42
1.51
95955126--95955259
22
6.0
22
75
11
112
23
21
17
36
1.95
95955100--95955234
44
3.0
43
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7
137
22
21
18
37
1.95
95955376--95955587
105
2.0
105
100
0
424
33
2
20
43
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95962101--95962140
21
1.9
21
94
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37
0
22
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1.54
95962188--95962231
15
3.0
14
83
9
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50
0
20
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95962800--95962876
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23
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95966265--95966394
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2.7
48
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1
188
31
21
25
21
1.98
95966264--95966486
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49
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149
29
21
27
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1.99
95969105--95969251
37
4.0
37
95
0
249
26
31
18
23
1.97
95969458--95969628
47
3.6
47
89
0
261
26
28
11
34
1.90
95980915--95981143
47
4.9
47
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6
200
22
28
19
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1.98
95980923--95981134
46
4.6
45
81
7
176
22
28
18
29
1.98
95982429--95982522
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2.3
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1.94
95989813--95989907
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40
84
8
122
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29
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1.97
96006466--96006609
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42
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1.95
96009605--96009644
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3.1
13
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0
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15
27
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20
1.92
96018803--96018829
13
2.1
13
100
0
54
14
33
37
14
1.88
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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20
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10
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36
0
14
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50
7.7
50
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7
349
26
16
26
30
1.97
96026956--96027340
101
3.8
101
76
7
300
26
16
26
30
1.97
96026954--96027328
151
2.5
150
92
0
606
26
16
26
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1.96
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2.0
16
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0
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0
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1.94
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1.98
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1.98
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1.94
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1.95
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24
22
1.86
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29
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104
26
13
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1.93
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1.9
174
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0
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28
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1.99
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2.9
93
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0
379
21
18
28
31
1.97
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21
18
28
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1.97
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43
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17
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30
1.96
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4.7
46
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9
176
33
20
24
21
1.97
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141
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33
20
24
21
1.97
96082297--96082609
46
6.6
48
71
11
193
28
18
29
23
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
96082303--96082617
96
3.3
96
76
11
249
27
18
29
23
1.98
96082297--96082615
47
6.7
49
69
14
170
28
18
29
23
1.98
96083732--96083772
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1.9
22
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5
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9
43
29
17
1.80
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14
2.0
15
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20
0
20
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1.84
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24
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0
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27
22
25
2.00
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29
2.7
29
86
5
106
27
32
15
24
1.95

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          369   370   371   372   373