Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A08
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  123748673

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  258  of  373  ( 44737 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.10
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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T
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(0-2)
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1.83
87541207--87541395
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1.83
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26
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2.3
24
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21
1.90
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Matches
Percent
Indels
Score
A
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1.55
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20
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134
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434
28
19
18
34
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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17
23
1.97
87661141--87661565
47
9.1
47
91
0
647
26
31
10
32
1.89
87661273--87661350
25
3.2
25
65
17
65
28
28
7
35
1.85
87661439--87661513
22
3.3
22
65
17
62
26
33
10
29
1.90
87665471--87666081
40
15.6
40
92
4
1003
25
28
21
23
1.99
87665676--87665731
28
2.0
28
96
0
103
25
26
21
26
1.99
87667879--87667957
36
2.2
37
84
6
99
27
31
16
24
1.96
87668076--87668523
47
9.6
47
89
2
645
26
31
9
32
1.88
87668217--87668294
25
3.2
25
65
17
74
29
28
7
34
1.85
87668383--87668457
22
3.3
22
65
17
62
26
33
10
29
1.90
87675213--87675338
28
4.5
28
95
1
227
34
26
11
27
1.90
87675212--87675363
28
5.4
28
91
1
171
34
26
11
27
1.91
87676464--87676545
23
3.5
22
77
9
83
34
19
20
25
1.96
87676486--87676555
22
3.1
22
74
11
70
35
18
21
24
1.95
87679209--87679254
19
2.4
18
82
7
56
56
4
0
39
1.19
87685645--87685686
18
2.4
18
84
4
59
47
0
7
45
1.30
87693533--87693805
40
6.8
40
89
2
386
24
29
21
24
1.99
87693532--87693805
122
2.3
120
88
1
413
24
29
21
24
1.99
87698859--87698898
21
1.9
21
85
10
55
47
12
17
22
1.81
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
87699895--87700105
46
4.5
45
76
9
147
27
18
30
23
1.97
87699890--87700059
46
3.7
46
79
7
148
27
18
30
22
1.98
87705155--87705383
40
5.8
40
87
1
291
24
27
24
24
2.00
87709331--87709373
19
2.2
20
84
12
54
51
18
0
30
1.47
87712075--87712104
11
2.6
12
89
10
53
63
0
0
36
0.95
87721812--87721878
17
3.9
17
100
0
134
11
41
28
17
1.85
87723537--87723593
30
1.9
30
82
7
71
49
17
1
31
1.57
87729228--87730612
290
4.8
290
92
1
2263
29
15
18
36
1.92
87734779--87734969
27
7.1
27
82
7
192
41
20
8
29
1.82
87734812--87734969
81
2.0
81
87
7
232
41
18
8
32
1.80
87734778--87734997
27
8.2
27
83
7
186
40
20
9
30
1.83
87734800--87734998
54
3.7
54
84
6
235
39
19
9
31
1.83
87734814--87734992
81
2.2
81
84
7
222
41
16
9
32
1.81
87734935--87735010
27
2.8
27
87
0
89
38
18
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28
1.90
87734898--87735010
54
2.1
54
80
6
122
40
16
12
30
1.85
87735421--87735472
27
2.0
27
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7
63
15
23
25
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1.93
87735709--87735738
8
3.8
8
100
0
60
53
23
23
0
1.46
87736365--87736503
60
2.3
60
82
7
167
26
20
25
26
1.99
87737164--87737198
18
2.1
17
89
10
54
42
11
20
25
1.85
87744036--87744199
27
6.0
26
82
7
184
19
23
20
35
1.95
87744036--87744193
54
2.9
54
89
1
228
19
24
20
36
1.95
87750977--87751127
40
3.8
40
81
5
155
23
29
23
23
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
87755355--87755501
27
5.4
26
85
7
186
17
23
23
35
1.95
87755355--87755501
54
2.7
54
92
1
240
17
23
23
35
1.95
87757855--87757889
16
2.2
16
90
5
54
17
22
5
54
1.64
87760509--87761124
48
12.9
48
95
0
1090
34
6
28
31
1.81
87761264--87761367
37
2.8
37
89
4
165
23
18
30
27
1.97
87762641--87762753
40
2.8
40
87
0
172
23
22
28
26
1.99
87764351--87764535
79
2.3
81
83
7
227
24
22
27
24
2.00
87764352--87764535
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9
207
25
22
27
24
2.00
87764404--87764558
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2.0
79
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7
199
26
21
27
25
1.99
87772255--87772437
40
4.6
39
83
6
210
25
21
27
25
1.99

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          369   370   371   372   373