Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A08
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  123748673

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  273  of  373  ( 44737 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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29
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2.2
22
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2
2
53
1.25
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
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G
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19
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1.98
92676395--92676656
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2.1
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2.0
30
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0
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2.0
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11
24
1.90
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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T
Entropy
(0-2)
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14
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1.94
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2.1
16
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2
64
1.15
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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(0-2)
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1.99
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54
2.0
54
100
0
218
35
16
5
42
1.72
92781434--92781700
138
1.9
137
81
2
320
37
25
19
17
1.93
92781276--92781731
69
6.6
69
73
4
274
36
25
19
18
1.94
92781804--92781950
57
2.6
57
82
1
170
38
17
12
31
1.88
92797848--92797905
28
2.1
27
84
6
82
53
1
25
18
1.54
92798921--92799017
50
1.9
50
89
0
149
38
15
15
30
1.89
92801090--92801190
53
1.9
53
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8
125
57
4
5
31
1.44
92802868--92803285
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45
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14
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28
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18
28
1.98
92803525--92803829
88
3.5
87
83
4
389
29
20
20
29
1.98
92803650--92803793
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3.3
44
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30
20
20
28
1.98
92803847--92804665
130
6.3
130
85
2
980
26
22
21
30
1.99
92803923--92804301
86
4.4
86
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6
300
26
22
21
29
1.99
92803972--92804341
86
4.3
87
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7
295
25
22
22
30
1.99
92803874--92804605
44
16.8
44
69
8
284
25
22
20
30
1.98
92803922--92804742
261
3.1
262
88
2
1098
25
23
20
30
1.99
92804532--92804647
44
2.6
44
79
5
119
25
25
20
28
1.99
92805948--92805990
19
2.2
19
87
4
59
2
11
0
86
0.67
92811427--92811507
29
2.8
28
81
9
81
58
2
3
35
1.29
92811695--92811757
25
2.5
25
73
19
67
60
4
4
30
1.38
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
92813122--92813163
18
2.5
17
81
11
50
45
2
4
47
1.36
92814671--92814708
12
3.2
12
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7
51
52
0
0
47
1.00
92818456--92818760
46
6.5
46
76
11
214
23
30
18
27
1.98
92818353--92818763
94
4.4
94
74
14
328
24
29
18
27
1.98
92818353--92818760
47
8.7
47
72
16
251
24
29
18
27
1.98
92821781--92821810
10
2.8
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10
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36
0
10
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2.0
53
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3
131
27
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17
1.92
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2.0
29
100
0
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113
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26
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1.98
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3.1
18
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1.70
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129
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23
1.92
92851297--92851426
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2.0
66
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6
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13
25
17
43
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194
2.0
194
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0
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1.84
92858178--92858230
23
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22
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18
1
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1.25
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21
1.9
21
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0
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10
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25
1.9
25
91
0
78
35
18
29
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1.93
92864633--92864683
21
2.4
21
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0
93
45
1
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19
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12
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92864785--92864926
42
3.4
41
82
9
155
28
16
19
35
1.93
92873815--92873899
34
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34
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100
43
1
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52
1.21
92873815--92873891
36
2.0
40
85
9
108
42
1
2
53
1.23
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
92888278--92888318
13
3.1
14
75
10
50
19
14
17
48
1.81
92888514--92888552
19
2.2
19
86
9
55
30
0
12
56
1.37
92908670--92908713
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3.9
11
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70
9
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15
1.30
92908670--92908726
23
2.4
24
88
2
80
70
8
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15
1.31
92908672--92908726
12
4.6
12
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92920448--92920651
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40
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26
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0
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1
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15
1.11
92942609--92942673
17
3.8
17
76
6
60
73
3
6
16
1.16

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          369   370   371   372   373