Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A08
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  123748673

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  189  of  373  ( 44737 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
63524952--63525135
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80
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21
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1.99
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2.2
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80
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1.99
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10
222
23
22
27
25
2.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
A
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Entropy
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1.99
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28
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278
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29
20
21
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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Entropy
(0-2)
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181
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26
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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Entropy
(0-2)
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63740668--63740728
22
3.0
21
86
9
90
1
16
0
81
0.76
63740667--63740731
20
3.1
21
73
13
71
1
15
0
83
0.73
63749381--63749573
98
2.0
98
92
0
323
40
11
12
34
1.81
63758865--63758929
24
2.6
25
76
13
80
40
27
18
13
1.89
63760474--63760581
43
2.5
44
79
7
132
33
16
20
29
1.95
63764315--63764345
15
2.1
15
100
0
62
45
6
0
48
1.28
63764843--63764902
7
8.6
7
74
20
54
51
1
15
31
1.53
63767082--63767139
28
2.1
28
96
0
107
36
3
18
41
1.68
63767175--63767223
25
2.1
22
85
11
62
26
0
4
69
1.06
63773895--63774060
48
3.5
48
78
4
176
23
26
19
30
1.98
63773752--63774109
46
7.6
47
74
8
212
23
27
20
28
1.99
63773926--63774102
94
1.9
93
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6
250
22
25
20
31
1.98
63779727--63779893
46
3.6
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10
148
28
19
27
23
1.99
63787363--63787534
46
3.7
47
77
13
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28
18
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24
1.98
63787462--63787574
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7
147
28
18
29
23
1.98
63788626--63788650
13
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13
100
0
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32
28
40
0
1.57
63792777--63792920
52
2.8
52
90
0
225
20
28
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19
1.97
63794149--63794208
26
2.3
26
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0
93
38
21
21
18
1.94
63794134--63794211
26
3.0
27
79
7
90
37
20
23
19
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.2
13
100
0
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14
14
0
71
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15
2.1
15
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0
53
35
12
25
25
1.92
63806909--63806970
30
2.0
30
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3
88
50
12
16
20
1.78
63806909--63806979
30
2.3
30
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7
81
49
14
15
21
1.79
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58
2.3
58
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5
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4
0
45
1.22
63812251--63812290
19
2.1
19
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0
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10
1.53
63816774--63816816
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2.4
19
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7
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37
13
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63816782--63816818
19
1.9
19
100
0
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1.83
63816782--63816841
19
2.8
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0
0
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1.98
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1.9
25
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48
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2
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1.61
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2.0
15
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6
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51
20
0
27
1.47
63835410--63835693
50
5.8
50
83
5
314
28
19
29
21
1.98
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3.8
45
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6
201
25
17
29
27
1.97
63845103--63845160
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1.9
30
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0
89
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47
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13
224
27
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22
1.98
63845504--63845806
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3.3
92
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348
27
20
30
22
1.98
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0
51
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2.9
35
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123
17
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34
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63857490--63857652
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3.8
43
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25
19
25
1.98
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21
1.9
21
85
10
55
55
15
25
5
1.60
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
63872185--63872369
40
4.7
40
82
6
216
25
28
22
23
2.00
63872185--63872369
79
2.3
81
81
8
218
25
28
22
23
2.00
63874421--63874641
40
5.6
40
89
2
313
27
23
26
22
2.00
63879537--63879754
47
4.6
48
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12
132
23
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18
26
1.98
63883199--63883238
19
2.1
19
90
0
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30
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63887162--63887429
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240
22
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1.98
63904787--63904898
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0
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17
20
0
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1.32
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29
4.1
28
82
4
142
27
32
14
25
1.95

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          369   370   371   372   373