Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A08
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  123748673

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  264  of  373  ( 44737 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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T
Entropy
(0-2)
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3.0
54
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19
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Indels
Score
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1.16
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Score
A
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1.43
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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T
Entropy
(0-2)
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23
26
2.00
89910216--89910348
34
3.9
34
76
2
115
30
15
12
42
1.83
89911852--89911973
45
2.7
45
75
9
113
30
21
12
36
1.90
89913491--89913579
26
3.3
27
87
9
121
21
15
10
52
1.72
89913505--89913581
26
2.9
26
94
1
127
20
14
11
53
1.72
89916255--89916307
19
2.7
20
82
14
65
30
0
9
60
1.28
89916255--89916306
20
2.6
19
82
11
61
30
0
7
61
1.24
89921745--89921961
107
2.0
108
98
0
418
42
20
20
16
1.89
89924122--89924232
53
2.1
53
94
0
195
35
11
5
47
1.63
89928791--89928833
22
1.9
23
90
4
70
67
4
0
27
1.10
89946610--89946678
31
2.3
30
87
9
97
31
14
13
40
1.84
89952365--89952420
25
2.2
26
78
9
62
25
23
23
28
1.99
89959815--89959876
32
1.9
32
93
0
106
19
16
37
27
1.93
89965732--89965807
40
1.9
40
88
0
116
15
11
34
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1.84
89993048--89993130
42
2.0
42
100
0
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14
34
1.87
89993623--89993676
2
27.0
2
96
0
90
3
0
46
50
1.19
89995697--89995924
43
5.3
43
73
9
176
32
19
19
28
1.96
89998740--89998816
38
2.0
38
100
0
154
25
18
22
33
1.96
90001831--90001997
9
17.6
9
76
10
154
31
0
21
46
1.56
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
90001835--90001997
39
4.2
40
86
9
168
30
0
21
47
1.56
90001846--90001985
39
3.4
44
87
10
183
30
0
22
45
1.58
90001831--90001997
57
2.9
57
81
7
196
31
0
21
46
1.56
90001831--90001986
48
3.2
48
80
3
188
31
0
22
45
1.57
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23
2.2
23
100
0
100
34
16
16
34
1.90
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21
2.1
22
91
4
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26
0
26
46
1.53
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7
3.6
7
100
0
50
16
0
60
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1.36
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155
1.8
155
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22
19
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1.98
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2.1
40
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22
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1.94
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2.8
48
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4
194
34
23
14
26
1.94
90011271--90011433
40
4.1
40
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4
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23
22
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25
2.00
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37
2.0
37
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0
137
31
26
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34
1.86
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21
2.2
22
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3
60
59
4
4
31
1.36
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19
2.7
19
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59
1
0
38
1.08
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2.6
27
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2
0
43
1.15
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61
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1.54
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2.0
33
96
0
123
30
16
15
37
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40
5.7
40
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226
24
21
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17
2.0
17
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0
50
70
0
0
29
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14
2.0
14
100
0
56
42
0
14
42
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14
2.1
14
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0
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10
0
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1.36
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48
2.0
48
87
8
138
19
12
27
40
1.88
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
90092143--90092241
27
3.7
27
85
4
121
41
21
6
31
1.77
90092694--90092825
27
5.0
27
82
6
117
37
19
11
31
1.87
90092673--90092852
80
2.3
79
79
7
177
37
20
12
29
1.89
90092813--90093029
27
8.0
27
86
0
281
34
18
21
25
1.96
90092781--90093015
81
2.9
81
84
4
298
34
17
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1.95
90093232--90093326
25
3.8
25
92
0
154
26
25
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25
2.00
90093232--90093339
25
4.4
25
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109
28
23
23
25
1.99
90101616--90101653
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19
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5
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1.39
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2.5
13
94
0
55
59
0
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1.13
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14
2.3
14
94
0
55
81
3
12
3
0.93

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          369   370   371   372   373