Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A08
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  123748673

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  330  of  373  ( 44737 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Percent
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Percent
Indels
Score
A
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Percent
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Score
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17
1.87
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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(0-2)
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19
27
1.78
110974050--110974094
19
2.4
18
86
13
65
0
33
0
66
0.92
110982596--110982633
20
1.9
20
94
0
67
21
39
26
13
1.89
110983371--110983427
30
1.9
30
96
0
105
31
15
7
45
1.73
110986528--110986560
13
2.6
13
90
4
50
39
0
12
48
1.40
110986839--110986864
5
5.2
5
100
0
52
38
0
0
61
0.96
110991955--110992016
5
12.2
5
77
19
58
16
1
0
82
0.75
110991957--110992017
6
10.7
6
83
13
67
14
1
0
83
0.72
110991955--110992016
11
5.5
11
76
17
65
16
1
0
82
0.75
110991957--110992032
22
3.4
22
79
13
84
15
3
0
80
0.86
110992934--110992967
17
1.9
18
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5
52
23
20
5
50
1.70
110998822--110998884
31
2.0
31
93
0
108
11
14
20
53
1.70
111006508--111006600
35
2.7
35
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0
132
29
9
10
50
1.69
111026826--111026904
39
2.0
40
95
4
144
16
16
10
56
1.65
111026837--111026898
19
3.2
19
69
13
63
12
14
8
64
1.49
111032857--111032881
12
2.1
12
100
0
50
76
0
24
0
0.80
111036421--111037108
205
3.4
205
93
0
1169
31
18
21
29
1.96
111036936--111037272
164
2.1
164
90
0
530
31
18
21
29
1.96
111036731--111037477
369
2.0
369
91
0
1215
31
17
21
29
1.97
111037100--111037948
205
4.1
205
91
0
1324
31
18
21
29
1.97
111036526--111037682
574
2.0
574
91
0
1855
31
18
21
29
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
111036423--111037887
779
1.9
775
89
1
2189
31
18
21
29
1.97
111039397--111039446
11
4.7
11
70
9
50
42
0
0
58
0.98
111039404--111039481
29
2.7
29
76
7
79
42
1
1
55
1.16
111039536--111039586
20
2.5
21
81
9
61
31
1
1
64
1.15
111042196--111042235
21
1.9
21
89
0
62
55
5
7
32
1.50
111042646--111042706
31
2.0
31
93
0
104
40
11
11
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1.77
111048127--111048264
50
2.8
49
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2
161
30
15
21
32
1.94
111048430--111048528
37
2.7
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30
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25
26
1.98
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2.1
13
100
0
54
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37
14
1.88
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36
2.1
36
100
0
148
24
5
32
37
1.78
111080316--111080403
25
3.6
25
80
10
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25
18
1.91
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25
2.5
24
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7
56
33
20
28
17
1.95
111087389--111087448
10
6.0
10
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7
77
23
6
1
68
1.22
111087391--111087447
30
1.9
30
89
7
89
22
7
1
68
1.23
111088168--111088201
18
1.9
18
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5
52
23
8
2
64
1.36
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12
4.3
12
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13
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20
1
0
77
0.86
111093793--111093846
25
2.2
24
87
12
74
20
1
0
77
0.86
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10
5.7
9
87
8
58
23
7
1
67
1.24
111095429--111095488
20
3.0
19
85
9
84
21
8
1
68
1.25
111095429--111095487
30
2.0
30
87
12
86
22
8
1
67
1.26
111101411--111101515
46
2.3
44
84
12
142
26
28
15
29
1.96
111107048--111107081
18
1.9
17
88
5
50
0
11
2
85
0.71
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
111108236--111108297
16
3.9
15
79
10
61
80
3
1
14
0.91
111108233--111108312
20
3.9
19
76
11
70
78
2
2
16
0.96
111108238--111108312
13
5.9
12
75
15
62
80
2
2
14
0.94
111109998--111110068
35
2.0
35
97
0
133
35
18
11
35
1.86
111110602--111110644
19
2.3
19
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4
79
30
9
18
41
1.82
111113687--111113717
13
2.4
13
100
0
62
54
16
0
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1.42
111116627--111116671
6
7.5
6
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0
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2
2
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100
0
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0
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1.39
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16
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0
50
41
2
20
35
1.68
111126371--111126412
19
2.2
19
100
0
84
42
14
11
30
1.81

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
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          369   370   371   372   373