Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A08
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  123748673

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  77  of  373  ( 44737 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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T
Entropy
(0-2)
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1.30
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Percent
Indels
Score
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C
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15
35
1.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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22
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25
2.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Score
A
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(0-2)
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3
276
35
17
23
24
1.95
23895371--23895425
21
2.6
21
85
0
74
16
32
30
20
1.94
23899666--23899774
42
2.6
42
82
2
139
29
25
16
28
1.97
23903001--23903037
19
1.9
19
88
0
56
43
2
16
37
1.62
23903621--23903648
12
2.3
12
100
0
56
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0
0
60
0.97
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13
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14
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7
55
62
0
10
27
1.27
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21
8.0
23
78
10
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20
22
21
35
1.96
23905115--23905240
42
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41
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1
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17
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23
33
1.96
23905068--23905227
63
2.5
64
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4
169
20
25
21
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1.97
23905567--23905625
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25
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0
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22
2.0
22
100
0
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22
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8
33
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23915614--23915662
25
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25
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0
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1.70
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28
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24
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1.96
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27
3.8
26
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20
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23919199--23919303
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20
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58
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18
2.0
18
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0
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0
22
38
1.54
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46
2.8
46
79
12
131
19
20
29
30
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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31
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0
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26
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23
1.99
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25
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25
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22
22
23
31
1.98
23975094--23975217
50
2.5
50
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180
22
22
23
31
1.98
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40
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40
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1.99
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1.99
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38
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1.99
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76
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2
328
22
23
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1.99
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1.9
116
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0
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23
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1.99
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10
100
0
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0
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15
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1.96
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96
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337
26
15
29
28
1.96
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2.2
144
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8
371
26
16
28
28
1.97
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11
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33
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36
1.84
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25
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26
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2.1
30
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25
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27
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26
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28
30
1.94
24017382--24017533
55
2.8
55
94
0
259
26
13
28
30
1.94
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55
3.1
54
85
6
213
25
13
29
31
1.93
24025356--24025506
28
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232
26
13
28
31
1.94
24025356--24025519
27
6.0
27
88
4
152
28
13
26
31
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
24037096--24037208
27
4.2
26
79
10
111
19
23
20
37
1.95
24037096--24037208
55
2.1
54
85
5
147
19
23
20
37
1.95
24046172--24046220
25
2.0
25
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0
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42
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36
1.70
24061690--24061721
14
2.2
15
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5
57
71
0
0
28
0.86
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2.0
65
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2.0
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26
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1.98
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2.3
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7
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2.00
24064366--24064550
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24064419--24064583
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79
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201
27
20
27
24
1.99
24069521--24069648
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2.0
65
96
0
238
22
14
18
43
1.87

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          369   370   371   372   373