Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A08
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  123748673

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  21  of  373  ( 44737 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6025308--6025535
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0
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0
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2.7
19
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0
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1.09
6027299--6027352
21
2.7
20
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21
58
72
0
14
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1.13
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1.9
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2.2
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4.0
42
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6
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1.9
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0
217
27
27
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1.98
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2.5
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188
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0
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0
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0
0
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0.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6064469--6064529
31
2.0
31
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3
39
1.33
6064515--6064639
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2.0
61
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0
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15
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1.68
6066041--6066086
23
2.0
23
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20
2.2
20
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38
6
0
54
1.27
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3
0
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2.0
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2.0
19
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2.0
29
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36
20
24
18
1.95
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15
1.9
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43
3
0
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1.17
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2.5
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62
0
0
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32
0
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1.9
25
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62
27
0
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64
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257
29
0
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47
1.56
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91
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7
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1.9
21
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0
0
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2.0
160
99
0
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20
20
24
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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5
0
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1.17
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4.8
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1
0
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16
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1
0
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2.1
18
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0
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10
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2.4
33
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26
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23
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4
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1.19
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1.59
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2.0
33
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0
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0
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0
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2
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0
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0
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2
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19
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2
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2.9
29
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2
3
29
1.24
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28
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12
104
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2
5
31
1.36
6154539--6154696
38
4.2
39
72
17
113
62
3
4
30
1.31
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6154681--6154738
19
2.8
21
77
20
59
63
3
8
24
1.38
6156995--6157601
243
2.5
246
88
4
868
32
15
17
34
1.91
6161953--6162564
239
2.6
239
96
0
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35
21
15
28
1.93
6163519--6163677
35
4.7
35
75
9
159
33
23
11
32
1.90
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2.0
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0
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21
13
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17
1.9
18
94
5
61
55
5
11
26
1.58
6171670--6171845
46
3.8
45
75
12
169
22
21
27
28
1.99
6171667--6171838
93
1.8
93
91
0
281
22
21
27
27
1.99
6172761--6172806
10
4.6
10
89
10
60
69
2
6
21
1.22
6174288--6174390
18
5.4
18
69
13
71
36
23
25
14
1.93
6174308--6174372
21
3.2
21
74
12
82
40
21
26
12
1.88
6174290--6174390
39
2.6
39
96
0
184
37
22
25
13
1.92
6174793--6174833
21
1.9
22
85
5
57
36
14
4
43
1.67
6175600--6175634
16
2.1
18
89
10
56
37
14
2
45
1.59
6177648--6177756
5
21.6
5
71
15
82
74
1
3
20
1.07
6177648--6177725
27
2.8
28
82
9
97
74
1
2
21
1.01
6180736--6180769
17
1.9
18
94
5
61
55
5
11
26
1.58
6181483--6181532
10
5.0
10
86
13
68
70
2
8
20
1.23
6183130--6183161
11
2.8
12
86
13
50
34
0
0
65
0.93
6183395--6183446
21
2.6
20
88
11
72
75
5
9
9
1.20
6184739--6184804
17
3.9
17
76
20
59
56
0
4
39
1.20
6184735--6184809
17
4.6
16
73
20
57
57
1
4
37
1.26
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6185781--6185874
23
4.1
23
85
0
134
47
4
25
22
1.69
6190287--6190380
23
4.1
23
85
0
134
47
4
25
22
1.69
6192487--6192521
18
1.9
18
94
0
61
45
5
8
40
1.58
6192545--6192634
30
2.9
30
80
8
83
56
7
8
26
1.57
6200459--6200496
17
2.2
17
86
9
51
60
0
2
36
1.11
6203006--6203073
19
3.3
20
76
15
68
64
0
7
27
1.20
6203012--6203097
21
4.3
20
76
19
74
63
2
5
27
1.29
6202883--6203073
10
19.6
10
68
16
64
63
2
5
28
1.29
6203538--6203715
85
2.1
85
84
3
223
37
6
14
42
1.72
6205654--6206256
248
2.4
248
93
1
996
32
15
18
33
1.92
6215420--6215646
93
2.4
93
91
0
337
32
11
20
35
1.89
6215493--6215700
33
6.5
33
79
6
221
32
11
21
35
1.89
6215477--6215676
93
2.1
93
93
0
337
32
11
21
36
1.88
6215579--6215716
66
2.1
67
80
5
163
36
10
21
31
1.88
6218357--6218402
8
5.9
8
80
12
51
10
4
0
84
0.75
6226645--6226680
17
2.1
17
100
0
72
38
5
11
44
1.63
6227647--6227694
24
2.0
24
100
0
96
33
37
4
25
1.75
6230678--6230831
25
6.2
26
79
8
144
19
27
19
33
1.96
6233045--6233082
20
1.9
20
84
10
51
42
13
23
21
1.88
6234977--6235158
46
4.0
46
89
1
240
39
14
24
21
1.91
6236536--6236584
14
3.3
14
81
15
62
65
0
2
32
1.04
6243668--6243697
6
5.0
6
95
0
51
0
16
13
70
1.18
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6244231--6244256
3
8.7
3
100
0
52
69
0
30
0
0.89
6246682--6246722
21
2.0
21
95
0
73
26
19
2
51
1.59
6255130--6255199
33
2.1
33
84
5
88
62
2
2
31
1.24
6255259--6255299
18
2.2
19
87
12
59
68
4
0
26
1.10
6255279--6255324
23
2.0
24
83
12
60
63
6
2
28
1.31
6258640--6258685
23
2.0
23
84
12
60
34
15
19
30
1.93
6273486--6273543
30
1.9
30
93
6
100
20
34
27
17
1.95
6274691--6274728
20
2.0
20
89
5
60
23
7
5
63
1.42
6281283--6281341
23
2.6
23
86
2
75
11
11
1
74
1.15
6281444--6281498
26
2.1
26
96
0
101
25
27
12
34
1.92

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
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          369   370   371   372   373