Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A08
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  123748673

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   

This is table  210  of  373  ( 44737 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
71362852--71363074
40
5.6
39
83
5
216
25
27
21
25
1.99
71362850--71363074
80
2.8
79
80
7
240
25
27
21
25
1.99
71363006--71363083
40
1.9
41
82
10
97
26
28
20
24
1.99
71370267--71370438
40
4.3
40
87
2
213
26
27
20
25
1.99
71370269--71370491
40
5.6
39
82
5
207
26
27
21
25
1.99
71370423--71370500
40
1.9
41
82
10
97
26
28
20
24
1.99
71373524--71373566
19
2.3
19
81
14
54
37
4
4
53
1.43
71374278--71374315
17
2.2
18
85
4
51
60
2
10
26
1.43
71386692--71386780
42
2.1
42
93
0
151
32
31
16
19
1.94
71391669--71391824
42
3.7
43
82
5
174
31
25
15
28
1.96
71393817--71393871
27
2.0
27
96
0
101
29
29
10
30
1.91
71401311--71401393
43
1.9
43
85
0
112
30
24
18
27
1.98
71409409--71409463
27
2.0
27
100
0
110
25
0
18
56
1.42
71411460--71411496
16
2.3
16
100
0
74
27
10
18
43
1.83
71412513--71412537
11
2.3
11
100
0
50
76
8
8
8
1.18
71412644--71412676
9
3.7
9
95
0
57
39
12
18
30
1.87
71412644--71412689
9
5.0
9
89
2
56
39
15
15
30
1.88
71412733--71412766
9
3.8
9
92
0
50
47
14
11
26
1.79
71412730--71412766
18
2.1
18
94
0
65
48
13
10
27
1.75
71429319--71429396
29
2.7
28
84
11
104
25
15
30
28
1.96
71429349--71429675
173
1.9
174
93
0
566
30
14
24
31
1.94
71436178--71436410
49
4.7
50
81
2
263
25
17
26
30
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
71438310--71438338
12
2.4
12
100
0
58
58
24
10
6
1.55
71439432--71439586
42
3.7
42
83
10
181
29
24
17
29
1.97
71445749--71445809
30
2.0
30
87
0
86
39
6
22
31
1.80
71446520--71446669
67
2.2
67
81
8
171
32
17
28
21
1.96
71446544--71446727
67
2.8
64
77
8
194
29
17
29
22
1.97
71454239--71454412
40
4.4
39
82
6
181
24
22
27
25
2.00
71454239--71454412
80
2.2
79
83
5
208
24
22
27
25
2.00
71462274--71462447
40
4.4
39
83
6
190
23
22
28
25
2.00
71462274--71462447
80
2.2
79
84
3
215
23
22
28
25
2.00
71483333--71483400
34
2.0
34
97
0
127
25
11
19
44
1.84
71486916--71487183
40
6.7
40
91
2
441
25
26
23
24
2.00
71492826--71492878
21
2.5
20
79
8
61
16
37
32
13
1.88
71496113--71496344
49
4.7
49
83
3
302
29
27
18
24
1.98
71496113--71496344
100
2.3
98
85
2
320
29
27
18
24
1.98
71496591--71496644
27
2.0
27
85
0
72
38
14
7
38
1.75
71499896--71499953
29
2.0
29
89
0
89
44
5
17
32
1.70
71512556--71512730
46
3.8
46
78
10
203
28
28
20
22
1.99
71512564--71512734
93
1.8
93
93
0
297
28
28
21
22
1.99
71513157--71513216
30
2.0
30
90
0
93
30
25
8
36
1.85
71520139--71520310
46
3.7
46
78
13
208
29
28
20
22
1.98
71520147--71520316
93
1.8
92
94
1
304
28
28
21
21
1.99
71522014--71522058
20
2.2
20
88
0
63
35
13
0
51
1.41
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
71525694--71525744
26
2.0
26
84
7
68
0
25
3
70
1.04
71525753--71525796
20
2.0
23
87
12
67
25
0
4
70
1.06
71531522--71531551
15
1.9
16
93
6
53
30
23
0
46
1.52
71532156--71532207
19
2.9
19
80
8
56
1
26
1
69
1.10
71532248--71532280
8
4.1
8
92
0
57
39
0
0
60
0.97
71532240--71532282
13
3.1
13
78
18
50
37
0
2
60
1.10
71546323--71546487
43
3.8
43
77
10
133
30
24
18
26
1.98
71548186--71548212
7
3.9
7
100
0
54
25
0
29
44
1.54
71548353--71548403
21
2.5
20
73
17
50
17
37
23
21
1.94
71548745--71548775
14
2.2
14
94
0
53
35
25
6
32
1.82
71552010--71552086
21
3.7
21
94
1
129
11
33
31
23
1.91
71555546--71555583
14
2.7
14
87
0
58
31
31
7
28
1.86
71559107--71559201
25
4.0
23
74
21
72
20
4
3
72
1.15
71559234--71559284
23
2.3
21
83
10
57
17
1
5
74
1.11
71563868--71563926
6
9.8
6
100
0
118
16
0
0
83
0.66
71565684--71565759
33
2.3
32
82
8
89
32
22
18
26
1.97
71570062--71570139
40
1.9
41
82
10
97
26
28
21
23
1.99
71577419--71577588
40
4.3
40
91
0
234
26
27
21
25
1.99
71577419--71577641
40
5.6
39
85
3
232
26
26
21
25
1.99
71577384--71577641
80
3.3
79
79
4
252
25
27
20
26
1.99
71577573--71577650
40
1.9
41
82
10
97
26
28
21
23
1.99
71579586--71579688
37
2.8
37
85
5
120
27
18
26
28
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
71579654--71579877
48
4.7
48
91
0
351
26
19
25
27
1.99
71579831--71579922
41
2.2
42
86
5
125
28
16
25
30
1.96
71583591--71583629
13
3.1
13
92
7
71
48
0
7
43
1.31
71584380--71584471
27
3.4
27
80
5
105
33
20
20
25
1.97
71585213--71585272
27
2.3
26
85
2
75
25
23
16
35
1.95
71591858--71592022
40
4.1
40
88
4
235
26
27
23
23
2.00
71594776--71594921
27
5.4
27
82
3
168
35
19
20
24
1.95
71605132--71605165
17
1.9
17
88
5
50
58
5
0
35
1.22
71605278--71605360
27
3.1
26
76
11
62
56
1
3
38
1.24
71605334--71605378
18
2.4
19
85
3
56
55
0
0
44
0.99
71605710--71605783
21
3.6
21
71
12
64
37
2
2
56
1.28
71611441--71611480
22
1.9
22
85
10
57
67
2
0
30
1.04
71611460--71611493
15
2.3
15
90
10
52
64
0
0
35
0.94
71616365--71616392
8
3.5
8
100
0
56
25
0
0
75
0.81
71622868--71623153
48
6.0
48
78
6
276
27
16
29
25
1.97
71622924--71623156
96
2.4
96
87
4
353
28
17
29
25
1.97
71622868--71623151
144
2.0
144
81
5
342
28
16
29
26
1.97
71626100--71626170
35
2.0
35
97
0
133
28
8
26
36
1.86
71630457--71630681
40
5.6
40
83
4
265
22
22
28
26
1.99
71630461--71630615
83
1.9
83
91
0
256
22
22
29
25
1.99
71635786--71636164
47
8.1
47
92
0
571
28
30
8
32
1.87
71638449--71638698
96
2.6
96
81
7
285
28
18
27
25
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
71638449--71638699
48
5.2
47
74
10
206
27
18
27
25
1.98
71638944--71638978
18
1.9
18
88
0
52
31
11
22
34
1.90
71640290--71640347
27
2.1
27
90
6
91
18
8
15
56
1.64
71640872--71640906
10
3.4
10
84
7
52
20
11
14
54
1.70
71645367--71645424
26
2.1
28
93
6
102
20
8
13
56
1.63
71665670--71665737
34
2.0
34
100
0
136
29
14
20
35
1.93
71665836--71666007
93
1.8
93
92
0
290
20
20
29
29
1.98
71665840--71666014
46
3.8
46
76
13
178
20
20
29
29
1.97
71668392--71668419
8
3.5
8
100
0
56
42
0
28
28
1.56
71669238--71669284
21
2.2
21
85
7
60
42
2
21
34
1.65
71671522--71671715
40
4.8
40
88
1
280
25
27
22
24
2.00
71671522--71671716
81
2.4
80
88
2
291
25
27
22
24
2.00
71673868--71674048
80
2.3
80
78
4
188
28
26
20
23
1.99
71673941--71674047
40
2.7
40
95
0
196
29
25
20
24
1.99
71682021--71682187
40
4.3
39
81
7
162
29
25
20
23
1.99
71682085--71682187
38
2.7
39
91
7
158
30
23
21
25
1.99
71695851--71696068
40
5.5
40
88
2
289
24
28
23
22
2.00
71697442--71697545
49
2.1
49
98
0
199
45
11
7
35
1.69
71708868--71709078
46
4.5
46
77
8
140
22
28
19
28
1.98
71708902--71709078
94
1.9
92
88
2
264
22
29
19
28
1.98
71732869--71733002
40
3.3
40
82
4
162
25
16
23
35
1.95
71737007--71737067
30
2.0
30
90
0
95
29
24
8
37
1.84
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
71741942--71741984
22
2.0
22
95
0
77
27
30
16
25
1.97
71742522--71742565
18
2.4
18
84
0
61
50
20
2
27
1.60
71742522--71742603
36
2.3
36
82
0
92
47
20
3
28
1.67
71747651--71747728
41
1.9
40
89
7
122
29
33
14
23
1.93
71747649--71747743
40
2.3
42
83
5
124
31
32
13
22
1.93
71754364--71754446
27
3.1
26
81
6
94
32
19
20
27
1.97
71754428--71754623
27
7.3
27
83
4
198
39
21
7
30
1.82
71754409--71754551
54
2.6
54
83
2
144
37
20
11
30
1.88
71754428--71754623
81
2.4
81
79
5
225
39
21
7
30
1.82
71754601--71754874
27
10.1
27
87
0
341
29
22
6
41
1.79

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373