Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A08
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  123748673

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  343  of  373  ( 44737 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Matches
Percent
Indels
Score
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Period
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Copy
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Period
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Percent
Indels
Score
A
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(0-2)
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3
11.7
3
100
0
70
68
0
0
31
0.90
114787910--114787987
38
2.1
38
95
0
138
44
15
10
29
1.79
114793253--114793344
37
2.5
37
89
5
132
50
1
4
44
1.29
114793503--114793541
16
2.4
16
82
0
51
28
30
10
30
1.90
114795900--114795952
21
2.5
21
84
6
63
20
32
33
13
1.91
114797025--114797091
25
2.7
25
86
4
82
31
22
23
22
1.98
114798189--114798213
11
2.3
11
100
0
50
64
0
0
36
0.94
114798757--114798781
11
2.3
11
100
0
50
28
0
0
72
0.86
114806684--114806736
27
2.0
27
96
0
97
52
16
7
22
1.69
114810779--114810912
64
2.1
65
95
2
243
37
4
3
54
1.39
114818178--114818224
21
2.2
22
88
3
69
19
31
19
29
1.96
114822851--114822875
13
1.9
13
100
0
50
40
8
8
44
1.63
114823161--114823195
18
2.0
17
88
5
52
54
5
2
37
1.39
114823405--114823451
20
2.3
21
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10
62
36
0
40
23
1.55
114826610--114826636
4
6.8
4
100
0
54
77
0
0
22
0.76
114827428--114827485
22
2.6
22
83
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68
8
5
17
1.33
114827416--114827483
11
6.2
11
73
0
55
69
7
4
19
1.30
114830030--114830060
11
2.8
11
95
0
53
19
48
3
29
1.64
114830603--114830677
18
4.2
18
89
0
105
28
24
16
32
1.96
114834725--114834755
11
2.8
11
95
0
53
19
48
3
29
1.64
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
114835952--114835990
21
1.9
20
89
5
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71
2
20
5
1.17
114844298--114844326
8
3.8
8
95
4
51
75
0
0
24
0.80
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44
2.1
44
81
4
105
22
19
22
34
1.96
114852832--114852917
28
3.0
28
88
3
127
29
29
13
27
1.95
114854324--114854355
16
2.0
16
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0
55
15
6
28
50
1.68
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18
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18
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0
107
33
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1.89
114854383--114854494
36
3.1
35
79
5
125
33
14
16
35
1.89
114861201--114861251
19
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23
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58
1.56
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3.2
26
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0
150
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4
23
36
1.76
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2.2
13
100
0
56
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0
0
78
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2.0
16
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22
0
0
77
0.77
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4.8
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94
0
68
39
27
9
23
1.85
114878920--114878982
29
2.2
28
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16
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1
4
30
1.24
114880536--114880566
14
2.2
14
94
0
53
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0
3
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1.12
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2.3
15
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5
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55
5
2
35
1.39
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2.6
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78
0
0
21
0.75
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21
1.9
21
100
0
80
40
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10
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1.80
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23
2.5
24
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10
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3
0
41
1.16
114916792--114916832
20
2.0
20
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0
55
31
7
14
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1.72
114919563--114919605
18
2.4
18
84
7
52
20
23
20
34
1.96
114922406--114922451
6
7.8
6
90
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17
19
15
47
1.82
114931694--114931869
46
3.8
46
79
12
216
20
21
29
28
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
114931691--114931862
93
1.8
93
96
0
317
20
21
29
27
1.98
114939261--114939436
46
3.8
46
79
12
207
20
20
29
29
1.98
114939258--114939429
93
1.8
93
94
0
308
20
20
29
28
1.98
114949225--114949302
25
3.2
25
65
26
67
8
65
1
24
1.29
114957959--114958033
9
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9
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12
5
2
80
0.99
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5.2
12
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58
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3
1
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0.95
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2.7
20
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3
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0
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1.12
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100
0
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14
0
0.95
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15
3.9
15
88
2
80
33
1
12
52
1.49

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
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          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
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          369   370   371   372   373