Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A08
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  123748673

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  164  of  373  ( 44737 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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Indices
Period
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Copy
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Score
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26
1.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
A
C
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Entropy
(0-2)
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Period
Size
Copy
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Percent
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Score
A
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(0-2)
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25
1.99
55029921--55029963
20
2.3
18
81
14
52
41
0
20
37
1.53
55030585--55030851
49
5.6
47
78
9
222
29
19
27
23
1.98
55030622--55030878
49
5.4
49
79
7
212
29
18
28
22
1.98
55030666--55030880
98
2.2
97
88
2
308
29
19
27
22
1.98
55034726--55034795
15
4.7
15
76
0
68
11
14
15
58
1.63
55034722--55034795
30
2.5
30
82
8
96
12
14
14
58
1.64
55037371--55037735
46
7.7
47
74
12
218
28
18
27
25
1.98
55037558--55037739
49
3.8
48
77
4
170
29
18
26
25
1.98
55037459--55037739
142
2.0
144
84
4
372
28
18
28
25
1.98
55041236--55041319
40
2.1
40
84
4
107
33
16
33
16
1.92
55047104--55047310
53
3.8
53
78
4
227
36
18
24
20
1.95
55050696--55050738
22
2.0
22
90
0
68
25
18
25
30
1.98
55054048--55054084
19
1.9
20
94
5
67
45
8
10
35
1.69
55059100--55059270
93
1.8
93
92
0
288
29
28
20
22
1.98
55059095--55059267
46
3.7
46
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13
183
30
27
20
22
1.98
55061633--55062337
40
17.6
40
94
0
1187
27
19
27
25
1.99
55069602--55070265
40
16.6
40
95
1
1145
27
19
27
24
1.99
55078546--55078605
29
2.0
30
83
3
77
30
25
6
38
1.81
55082775--55082816
22
1.9
22
95
0
75
47
16
7
28
1.73
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
55091035--55091183
42
3.6
41
72
6
131
29
23
15
31
1.95
55093189--55093221
14
2.5
14
90
9
52
21
9
27
42
1.83
55093299--55093469
51
3.4
51
79
4
141
27
16
28
26
1.97
55094524--55099821
971
5.5
971
97
0
9786
35
19
15
29
1.93
55111697--55111826
52
2.6
49
80
11
129
25
13
26
35
1.92
55118400--55118541
43
3.2
43
67
16
126
22
30
25
21
1.99
55118374--55118557
91
2.0
91
96
0
341
23
29
24
22
1.99
55137377--55137431
22
2.5
21
80
11
58
38
47
3
10
1.56
55138759--55138799
21
2.0
20
90
4
64
29
0
21
48
1.50
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30
2.1
30
100
0
124
37
6
22
33
1.80
55145560--55145712
48
3.2
45
74
13
130
33
27
17
21
1.96
55145589--55145726
48
2.9
50
76
10
144
35
28
16
18
1.93
55159587--55160041
47
9.5
47
90
4
667
32
9
30
28
1.88
55159587--55160041
143
3.2
141
90
3
694
32
9
30
28
1.88
55159845--55160041
102
1.9
102
87
0
286
31
10
30
26
1.90
55159892--55160005
55
2.1
55
91
0
183
28
13
31
26
1.93
55160160--55160238
37
2.1
37
88
4
115
25
18
30
25
1.98
55167196--55167439
40
6.1
40
90
3
334
23
22
27
26
2.00
55177004--55177221
40
5.5
39
90
2
278
26
28
22
22
1.99
55185056--55185144
34
2.5
37
83
7
121
22
31
21
24
1.98
55185118--55185199
28
2.8
30
77
20
102
25
30
21
21
1.99
55199582--55199759
40
4.5
40
90
3
254
25
28
23
23
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
55205510--55205639
47
2.8
47
88
4
183
33
29
16
21
1.95
55212087--55212116
16
1.9
15
93
6
51
33
23
0
43
1.54
55212316--55212457
50
2.9
50
86
1
187
30
27
16
24
1.97
55214609--55214831
39
5.7
39
88
1
304
30
29
21
18
1.97
55214904--55214985
28
2.9
28
79
0
92
28
24
12
35
1.91
55217449--55217703
55
4.8
53
77
11
231
36
15
24
23
1.94
55217456--55217705
108
2.4
110
78
11
290
35
16
24
23
1.94
55219020--55219238
45
4.8
45
83
8
264
28
31
20
20
1.97
55219073--55219242
93
1.8
92
93
1
295
28
30
20
21
1.98
55221775--55221950
46
3.8
46
76
10
178
21
20
28
29
1.98

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          369   370   371   372   373