Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A08
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  123748673

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  211  of  373  ( 44737 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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T
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(0-2)
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1.82
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Period
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Copy
Number
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Score
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26
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Score
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1.98
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Period
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A
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(0-2)
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1.09
71954410--71954456
19
2.4
21
76
20
57
38
0
2
59
1.09
71974605--71974782
27
6.6
27
82
3
178
30
27
15
26
1.96
71974626--71974781
82
1.9
81
86
3
224
30
27
15
26
1.96
71975243--71975268
12
2.2
12
100
0
52
42
0
7
50
1.31
71982663--71982840
27
6.6
27
84
3
205
29
28
15
26
1.96
71982684--71982839
82
1.9
81
88
3
233
29
28
15
26
1.96
71983323--71983349
12
2.2
12
100
0
54
40
0
7
51
1.30
71989515--71989692
27
6.6
27
83
3
205
26
15
28
29
1.96
71989516--71989671
82
1.9
81
88
3
233
26
15
28
29
1.96
71989512--71989692
82
2.2
81
83
2
229
27
15
27
29
1.96
71992916--71992971
15
3.7
16
88
7
82
60
10
16
12
1.58
71995901--71996072
93
1.8
93
89
0
272
27
27
22
21
1.99
71995902--71996069
46
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45
77
10
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28
27
22
21
1.99
72000567--72000617
15
3.4
15
72
8
50
50
29
0
19
1.48
72001138--72001192
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11
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8
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12
7
0
80
0.91
72001138--72001200
22
3.0
21
80
15
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14
6
0
79
0.92
72002033--72002063
3
10.3
3
100
0
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32
0
35
1.58
72002138--72002199
31
2.0
32
83
3
81
17
3
4
74
1.13
72002149--72002242
20
4.9
19
71
18
61
20
5
4
70
1.24
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
72009114--72009160
19
2.5
19
86
6
60
25
19
10
44
1.82
72018463--72018875
47
8.8
45
77
10
232
28
19
28
23
1.98
72018466--72018875
94
4.3
93
75
12
279
28
19
28
23
1.98
72019959--72020018
21
2.9
21
90
2
95
16
33
23
26
1.96
72020713--72020844
46
2.8
47
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3
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35
19
17
27
1.94
72020668--72020979
49
6.7
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7
218
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17
17
28
1.93
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47
4.7
48
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10
217
28
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23
1.97
72022869--72023091
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254
28
17
30
23
1.97
72024168--72024207
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1.9
21
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0
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12
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1.85
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100
0
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0
0
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1.9
20
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5
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1.19
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16
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42
0
0
57
0.99
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19
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20
4
0
75
0.98
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31
2.0
31
100
0
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22
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1.79
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17
2.1
17
100
0
70
48
11
17
22
1.79
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24
2.9
23
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24
13
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1.9
45
90
0
136
24
15
24
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1.94
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29
2.0
29
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44
1
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3.1
42
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11
141
28
19
23
28
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43
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42
75
11
150
26
18
24
29
1.98
72061603--72061648
22
2.1
22
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26
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17
50
1.70
72063463--72063560
46
2.1
46
96
0
178
29
6
21
42
1.77
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
72067166--72067208
19
2.3
19
87
0
59
20
20
23
34
1.96
72071540--72071620
21
3.9
21
95
1
146
23
28
38
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1.87
72075670--72075828
39
4.1
39
95
0
282
23
30
25
19
1.98
72093417--72093487
24
3.0
24
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12
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19
14
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32
1.92
72093427--72093497
24
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24
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0
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22
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0
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0
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0
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46
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24
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25
2.2
25
78
9
69
33
1
1
62
1.16

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          369   370   371   372   373