Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A08
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  123748673

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  327  of  373  ( 44737 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Indels
Score
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C
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558
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1839
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22
17
33
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Score
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147
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24
25
1.94
110033404--110033513
48
2.3
46
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139
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15
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1.94
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16
37
18
1.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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(0-2)
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77
28
15
32
22
1.95
110117755--110118228
27
17.6
27
75
7
279
37
20
11
30
1.87
110117755--110118228
54
8.8
53
80
5
414
37
20
11
30
1.87
110117755--110118228
81
5.9
80
78
4
409
37
20
11
30
1.87
110118182--110118243
27
2.3
27
88
5
90
38
11
12
37
1.80
110118197--110118273
27
2.9
27
84
0
91
35
19
18
27
1.95
110118248--110118488
120
2.0
120
99
0
473
27
16
21
34
1.95
110120255--110120320
32
2.1
32
100
0
132
30
22
18
28
1.97
110123391--110123543
44
3.6
42
75
11
141
32
26
15
25
1.96
110126758--110126834
40
1.9
40
81
0
91
22
24
18
35
1.96
110128286--110128362
37
2.1
37
97
0
145
37
19
23
19
1.94
110128350--110128412
22
2.9
22
81
9
65
34
14
28
22
1.93
110129708--110129820
29
4.0
29
79
2
104
28
25
15
30
1.96
110130031--110130073
8
5.4
8
82
0
59
6
23
20
48
1.73
110130031--110130073
16
2.7
16
92
0
77
6
23
20
48
1.73
110134185--110134294
29
3.9
29
80
3
125
28
30
15
25
1.96
110134531--110134575
16
2.8
16
77
12
56
11
22
17
48
1.78
110139566--110139649
26
3.2
25
78
6
96
38
13
9
39
1.77
110139783--110139818
18
2.0
18
88
0
54
19
22
0
58
1.40
110143523--110143601
10
7.7
10
71
19
56
67
2
1
29
1.12
110143863--110143935
27
2.8
24
73
16
67
34
1
2
61
1.19
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
110144987--110145062
37
2.1
36
83
11
93
40
2
2
53
1.28
110145987--110146025
19
2.1
19
85
9
53
41
0
2
56
1.13
110152740--110152815
11
6.8
11
70
24
52
42
1
2
53
1.23
110152758--110152884
68
1.9
68
83
6
168
44
3
3
48
1.34
110154015--110154101
22
4.0
22
86
0
111
29
27
31
11
1.92
110156159--110156186
14
2.0
14
100
0
56
14
21
14
50
1.78
110159844--110159893
6
8.2
6
93
2
55
16
26
0
58
1.38
110159844--110159893
12
4.1
12
86
2
64
16
26
0
58
1.38
110159844--110159892
18
2.7
18
90
3
71
16
26
0
57
1.40
110161723--110161818
45
2.1
46
86
7
133
38
7
2
52
1.41
110162226--110162286
31
2.0
31
100
0
122
31
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6
39
1.80
110163130--110163163
16
2.1
16
88
0
50
70
2
0
26
1.01
110167024--110167068
22
2.0
22
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0
72
33
2
15
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1.57
110170804--110170848
22
2.0
22
91
0
72
33
2
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1.57
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10
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10
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4
106
70
1
8
20
1.22
110180987--110181019
13
2.4
14
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5
50
42
12
0
45
1.41
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21
1.9
20
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5
60
48
20
2
28
1.62
110187628--110187673
23
2.0
23
100
0
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34
17
26
21
1.95
110209207--110209330
40
3.1
40
89
2
178
28
21
24
25
1.99
110209216--110209340
39
3.2
39
90
1
178
25
22
27
24
2.00
110209269--110209353
39
2.2
39
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0
134
25
22
29
22
1.99
110217987--110218084
51
1.9
51
95
0
178
32
10
16
40
1.82
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
110226322--110226450
64
2.0
64
100
0
258
43
9
20
27
1.82
110226322--110226424
34
3.1
34
60
16
81
44
6
22
26
1.77
110228050--110228093
15
2.9
15
89
0
70
31
36
13
18
1.90
110228113--110228180
33
2.1
33
86
5
93
22
36
23
17
1.94
110228389--110228429
21
2.0
21
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9
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21
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19
29
1.98
110228449--110228490
15
2.8
15
85
0
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11
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1.86
110230256--110230333
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2.8
28
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1.56
110231599--110231648
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2.3
21
83
13
57
42
20
2
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1.63
110232278--110232324
23
2.0
23
100
0
94
44
8
4
42
1.54

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          369   370   371   372   373