Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A08
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  123748673

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  346  of  373  ( 44737 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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Indices
Period
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Copy
Number
Consensus
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Percent
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Percent
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Score
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C
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19
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Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Indels
Score
A
C
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Entropy
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0
0
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0
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7
72
37
22
15
24
1.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
115695089--115695129
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14
14
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5.9
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6
57
1.53
115697204--115697236
13
2.5
13
90
0
57
15
3
0
81
0.80
115697318--115697383
15
4.4
16
66
12
50
24
3
1
71
1.09
115696913--115697766
293
3.0
292
84
7
1070
28
7
6
57
1.53
115697507--115697748
131
1.9
131
92
2
416
28
7
5
57
1.50
115697532--115697800
131
2.1
129
80
10
291
32
7
5
54
1.52
115707230--115707275
24
1.9
24
95
0
83
41
19
13
26
1.88
115714856--115714881
3
8.7
3
100
0
52
65
0
34
0
0.93
115726433--115726494
32
2.0
31
90
3
97
54
12
6
25
1.62
115726443--115726517
32
2.3
32
83
4
87
56
10
9
24
1.63
115727228--115727291
33
1.9
33
96
0
119
48
12
7
31
1.69
115731535--115731655
57
2.1
57
96
1
224
28
9
12
48
1.73
115733540--115733607
27
2.6
25
75
11
73
60
1
0
38
1.06
115734536--115734760
108
2.1
108
91
1
362
40
5
8
46
1.56
115746890--115746954
32
2.0
32
100
0
130
12
33
9
44
1.74
115756182--115756279
42
2.3
42
79
6
117
37
6
10
45
1.63
115756195--115756267
22
3.4
21
68
21
53
34
8
9
47
1.66
115761563--115761591
11
2.6
11
100
0
58
55
6
6
31
1.53
115761668--115761770
21
4.8
22
79
10
106
58
2
3
34
1.31
115761718--115761782
24
2.9
21
78
14
76
61
1
1
35
1.15
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
115761733--115761782
12
4.2
12
80
19
61
60
2
0
38
1.09
115761666--115761786
14
9.3
13
69
24
62
58
2
3
35
1.28
115761744--115761816
38
2.0
38
86
10
107
60
5
0
34
1.20
115761743--115761791
12
4.2
12
85
15
59
63
0
0
36
0.95
115761725--115761782
11
5.0
11
78
19
64
62
1
0
36
1.06
115762201--115762241
9
4.4
9
84
3
55
60
7
0
31
1.24
115764483--115764516
17
2.0
17
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0
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50
0
0
50
1.00
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2.0
43
100
0
174
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37
1.92
115773571--115773674
52
2.0
52
98
0
199
41
9
6
42
1.64
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3
18.7
3
92
0
94
30
0
1
67
1.01
115782437--115782557
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2.1
59
98
0
233
28
23
14
34
1.93
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17
3.4
17
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13
55
46
3
12
37
1.58
115802043--115802113
35
2.0
35
100
0
142
45
5
12
36
1.66
115803222--115803332
56
2.0
56
87
7
163
28
15
25
30
1.96
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95
1.9
95
85
2
251
36
14
7
42
1.73
115807098--115807285
95
2.0
93
82
5
225
36
12
6
44
1.70
115810922--115810980
27
2.2
27
81
6
66
15
23
15
45
1.84
115816397--115816707
156
2.0
154
89
3
473
38
16
11
33
1.85
115818538--115818607
9
7.7
9
76
19
65
8
10
2
78
1.06
115818539--115818569
8
3.8
8
95
4
53
9
9
0
80
0.90
115818538--115818607
17
3.8
18
74
22
65
8
10
2
78
1.06
115818577--115818614
18
2.2
18
85
4
51
7
7
7
76
1.17
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
115818585--115818658
36
2.1
36
85
10
98
20
5
4
70
1.24
115818612--115818659
18
2.7
17
75
9
51
27
4
2
66
1.21
115818646--115818735
23
4.1
22
70
20
64
43
0
2
54
1.12
115818675--115818744
22
3.1
22
78
10
63
41
0
1
57
1.08
115818667--115818733
21
3.2
20
78
14
64
43
0
2
53
1.16
115818997--115819040
19
2.3
19
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7
54
59
0
0
40
0.98
115819217--115819279
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2.4
27
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2
74
50
3
1
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1.27
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2.1
32
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1
73
1.12
115819326--115819368
18
2.5
17
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61
16
2
2
79
0.95
115819375--115819420
23
2.1
21
84
11
58
41
0
4
54
1.20

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          369   370   371   372   373