Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A08
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  123748673

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  71  of  373  ( 44737 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Percent
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Percent
Indels
Score
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1.15
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Percent
Indels
Score
A
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(0-2)
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1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Score
A
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(0-2)
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28
18
28
1.98
21814875--21815176
45
6.5
44
77
9
178
24
27
18
29
1.98
21814965--21815183
45
4.8
45
82
8
246
24
29
18
27
1.98
21817365--21817949
40
14.6
40
95
0
965
27
20
28
24
1.99
21824796--21824829
14
2.5
13
86
9
50
55
0
5
38
1.24
21825105--21825141
17
2.2
17
95
0
65
48
0
2
48
1.15
21825680--21825731
15
3.2
15
73
19
50
44
0
1
53
1.11
21825764--21825797
16
2.1
16
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10
52
41
2
0
55
1.15
21825833--21825863
16
1.9
16
100
0
62
51
3
0
45
1.17
21825952--21825976
6
4.2
6
100
0
50
80
0
0
20
0.72
21826457--21826498
19
2.4
17
81
18
50
30
2
0
66
1.04
21826458--21826499
18
2.3
19
88
12
61
28
2
0
69
1.01
21826620--21826663
17
2.4
19
81
7
56
63
0
9
27
1.24
21831027--21831070
17
2.8
15
83
16
54
54
2
2
40
1.25
21832712--21832796
42
2.0
42
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0
161
9
25
16
48
1.76
21836137--21836202
29
2.2
29
84
7
80
48
24
4
22
1.69
21837110--21837136
13
2.1
13
100
0
54
55
22
0
22
1.44
21837133--21837207
20
3.7
19
70
20
62
53
17
4
25
1.61
21837209--21837592
12
28.8
13
72
17
177
56
18
2
22
1.52
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
21837260--21837474
51
4.1
52
73
18
146
58
18
1
21
1.48
21837277--21837583
25
11.5
26
74
16
215
57
18
1
21
1.50
21837259--21837595
9
33.9
10
71
21
191
57
18
2
21
1.50
21837161--21837595
13
32.2
14
68
22
163
56
18
2
22
1.53
21837302--21837539
65
3.6
65
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1
352
57
18
2
21
1.51
21837296--21837638
49
7.1
49
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26
116
57
17
2
22
1.52
21837259--21837595
5
67.8
5
71
20
191
57
18
2
21
1.50
21838742--21838784
22
2.0
22
100
0
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4
4
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1.39
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23
18
26
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1.97
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30
2.0
30
83
0
77
39
4
22
32
1.76
21844936--21845112
40
4.4
40
87
2
228
38
20
20
20
1.94
21844936--21845098
81
2.0
80
89
1
245
39
20
19
20
1.93
21844969--21845133
41
4.1
40
85
2
141
35
21
21
21
1.96
21845309--21845355
7
6.7
7
80
0
58
27
0
25
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21845304--21845355
14
3.7
14
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0
23
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1.51
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7
19.1
7
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22
0
38
38
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2.1
15
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0
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50
0
0
50
1.00
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16
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0
109
35
35
0
29
1.58
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52
2.5
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3
183
29
24
20
26
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21858998--21859087
45
2.0
44
93
2
153
33
23
13
30
1.93
21862601--21862682
27
2.7
29
80
14
71
43
3
23
29
1.70
21865152--21865252
29
3.5
28
77
8
96
26
30
11
30
1.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
21865175--21865272
28
3.5
28
84
1
115
30
33
9
26
1.88
21866867--21866922
23
2.4
24
80
14
64
28
1
26
42
1.65
21871086--21871481
46
8.6
46
92
1
526
41
14
23
20
1.89
21871777--21871809
17
2.0
17
94
5
59
48
0
15
36
1.45
21874611--21874735
29
4.3
29
86
1
153
24
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28
1.96
21880422--21880578
77
2.0
77
97
0
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31
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20
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1.89
21885641--21885690
22
2.2
22
96
3
91
32
0
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0
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1.32
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1.9
62
82
1
148
44
10
1
44
1.48
21895389--21895510
46
2.6
46
85
7
149
27
18
28
25
1.98

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          369   370   371   372   373