Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A08
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  123748673

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  331  of  373  ( 44737 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.0
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Period
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Score
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1.56
Indices
Period
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A
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7
10
40
1.66
111303655--111303707
16
3.2
17
82
15
58
30
15
3
50
1.61
111303920--111304048
33
3.8
33
70
10
100
23
29
17
30
1.97
111303954--111304152
108
1.9
105
82
7
249
25
29
16
29
1.97
111310727--111310792
23
2.8
23
81
9
62
22
27
1
48
1.59
111312924--111312948
8
3.1
8
100
0
50
76
0
0
24
0.80
111312922--111313003
41
2.0
41
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13
98
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2
0
35
1.09
111313200--111313268
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30
20
2
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1.65
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14
2.0
15
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44
0
0
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29
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20
32
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111317484--111317518
17
2.0
18
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28
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2.5
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111337743--111337771
14
2.1
14
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0
58
0
6
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2
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23
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25
2.0
24
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1.98
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2.0
26
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24
38
1.80
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26
2.0
26
85
7
72
39
22
13
24
1.90
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.3
21
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12
2
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33
1.51
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48
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47
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209
26
20
30
22
1.98
111362087--111362412
47
6.8
48
70
12
172
26
20
30
22
1.98
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46
6.7
47
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11
215
27
19
30
22
1.98
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3.9
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322
27
19
30
23
1.98
111368667--111368975
140
2.2
143
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350
28
18
30
22
1.98
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29
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26
21
1.99
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110
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3
23
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0
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23
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1.65
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0
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15
0
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1.38
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0
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53
1.41
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3.5
22
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70
16
0
31
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1.45
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15
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14
0
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52
1.41
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22
2.0
22
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16
0
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1.48
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2.5
22
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23
0
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0
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1.54
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7
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20
0
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1.51
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9
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1.64
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48
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145
45
21
2
30
1.64
111379098--111379205
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1.9
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0
162
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21
0
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1.58
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22
0
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1.58
111384648--111384706
21
2.8
21
86
0
82
27
18
50
3
1.62
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
111385046--111385149
44
2.4
44
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1
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20
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31
28
1.97
111385036--111385432
43
9.2
42
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294
21
20
27
30
1.98
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34
2.5
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79
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29
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40
1.88
111396266--111396332
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2.0
33
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0
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22
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0
0
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0.91
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1.9
53
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0
143
18
16
20
44
1.87

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          369   370   371   372   373