Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A08
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  123748673

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  358  of  373  ( 44737 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
118627172--118627291
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33
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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22
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220
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12
37
1.82
118734120--118734191
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3.9
19
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10
105
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13
36
1.83
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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(0-2)
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1.97
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1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
A
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(0-2)
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241
31
13
28
26
1.93
118800497--118800575
17
5.1
15
72
23
58
34
3
0
62
1.14
118800498--118800555
30
2.0
29
86
3
80
34
5
0
60
1.19
118802290--118802381
37
2.4
38
75
14
91
33
30
20
15
1.93
118804129--118804428
135
2.3
132
79
8
315
35
19
18
27
1.95
118804815--118805267
238
1.9
238
98
0
870
47
15
13
22
1.81
118807581--118807606
3
8.7
3
100
0
52
69
0
0
30
0.89
118825797--118825860
31
2.1
30
88
2
92
46
6
10
35
1.64
118832411--118832571
49
3.2
49
68
16
150
33
10
12
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118832405--118832603
100
2.0
99
98
1
380
32
11
12
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1.78
118833232--118833271
21
1.9
20
85
10
53
67
2
2
27
1.16
118834701--118834767
33
2.0
33
100
0
134
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11
40
1.79
118835860--118835936
29
2.5
30
75
12
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51
10
11
25
1.70
118839144--118839182
20
2.0
20
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0
51
23
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10
48
1.78
118841349--118841434
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2.0
43
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0
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30
1.96
118841677--118841725
25
2.0
25
91
0
80
4
36
4
55
1.38
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8
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0
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0
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118844628--118844684
30
1.9
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92
0
96
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10
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31
1.79
118844694--118844739
19
2.5
18
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3
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2
4
58
1.30
118844851--118844902
21
2.5
21
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6
70
28
32
7
30
1.85
118860366--118860422
15
3.9
14
78
15
55
56
0
10
33
1.34
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
118865441--118865555
54
2.1
54
96
0
212
37
22
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33
1.81
118868960--118868990
10
3.1
10
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0
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0
6
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1.28
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14
2.4
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0
0
70
0.88
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13
2.2
13
100
0
56
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1.80
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2.0
28
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0
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1.87
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3
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0
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0
0
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0
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0
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1.23
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2.1
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0
3
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1.23
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2.3
24
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0
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1.97
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2.0
30
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1.57
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0
74
0
32
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1.05
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10.3
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92
7
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70
0
30
0
0.88
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6.0
41
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2
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21
1.98
118902761--118903003
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3.0
81
87
4
321
31
20
25
22
1.98
118903051--118903112
7
8.1
7
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45
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0
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15
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8
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32
0
20
1.51
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23
3.9
23
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13
83
46
30
0
22
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2
50
23
1
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118910010--118910043
14
2.3
15
90
5
52
50
0
2
47
1.16
118923851--118924080
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0
334
30
14
20
34
1.92
118924248--118924361
45
2.6
45
86
10
148
21
21
29
26
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
118925590--118925638
15
3.1
16
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14
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65
8
2
24
1.31
118927884--118927916
5
7.0
5
96
3
52
42
15
0
42
1.46
118934498--118934531
14
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50
0
0
50
1.00
118935191--118935237
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17
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42
2
0
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1.12
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100
0
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6
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2.1
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19
4
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68
1.31
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2
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0
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25
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3
0
40
1.18
118983749--118983788
8
5.1
8
90
6
64
0
15
0
85
0.61

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          369   370   371   372   373