Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A08
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  123748673

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          369   370   371   372   373   

This is table  20  of  373  ( 44737 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
5668065--5668109
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17
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2.7
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2.5
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0
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26
27
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1.99
5782342--5782524
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4.6
40
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194
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27
21
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2.2
80
84
10
223
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27
20
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3.2
40
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2
197
27
27
20
24
1.99
5790242--5790419
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4.4
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6
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28
20
24
1.99
5798995--5799052
20
2.8
21
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5
55
5
12
8
74
1.21
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1
0
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5802693--5802745
15
3.6
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66
1
0
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1.03
5802837--5802903
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0
0
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2.0
47
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27
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17
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18
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13
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15
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16
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63
49
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12
26
1.74
5811161--5811270
18
6.4
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17
71
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12
12
39
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5811161--5811299
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2.7
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12
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4.2
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89
57
0
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30
1.39
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13
2.6
13
90
4
52
57
2
0
40
1.14
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
5816718--5816796
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3
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24
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23
22
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1.98
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182
21
24
21
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2.0
22
82
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22
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184
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93
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0
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12
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2
5
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1.31
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0
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0
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133
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18
28
1.97
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2.1
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111
34
22
12
30
1.91
5863311--5864072
178
4.3
178
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998
28
22
17
30
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
5864195--5864219
12
2.1
12
100
0
50
24
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32
36
1.84
5875905--5876040
3
44.7
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67
5
67
60
2
8
29
1.37
5875906--5876020
13
8.9
12
71
17
65
60
1
8
28
1.36
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2.0
50
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0
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17
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22
51
60
0
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1.17
5895928--5895989
29
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29
91
2
99
51
4
1
41
1.33
5918267--5918318
19
2.8
18
81
16
61
78
0
11
9
0.95
5919218--5919254
6
6.2
6
87
0
56
18
16
16
48
1.81
5920551--5920583
11
2.7
13
81
18
52
9
6
15
69
1.34
5924215--5924251
20
1.9
18
89
10
56
35
18
0
45
1.50
5926769--5926865
39
2.5
39
93
0
158
35
26
25
12
1.92
5935303--5935332
2
15.5
2
93
6
53
46
0
0
53
1.00
5935655--5935875
90
2.4
90
83
4
275
40
18
7
33
1.79
5936074--5936138
30
2.3
30
81
7
73
66
0
6
27
1.15
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21
3.5
22
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16
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63
2
8
26
1.36
5936368--5936415
22
2.2
22
88
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27
2
4
66
1.21
5936388--5936480
30
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29
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34
1
1
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1.09
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27
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0
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0
59
0.98
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2.3
25
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3
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24
0
1
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11
2.3
11
100
0
50
0
8
0
92
0.40
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13
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7
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26
0
10
63
1.27
5940684--5940792
50
2.2
51
91
3
184
36
15
22
25
1.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
5941618--5942069
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9.8
46
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1
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21
24
14
40
1.90
5941618--5942069
139
3.3
138
88
1
636
21
24
14
40
1.90
5941618--5942055
185
2.4
185
93
0
725
20
23
14
40
1.90
5944443--5944526
31
2.7
31
90
0
132
26
19
26
28
1.98
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28
15
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29
1.96
5944595--5944720
49
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3
175
28
14
26
30
1.95
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43
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0
138
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1.91
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48
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0
187
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1.93
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2.3
18
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0
20
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1.91
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0
10
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0
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0
0
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2.1
38
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2
122
32
10
3
53
1.52
5980751--5981014
91
2.9
89
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7
336
42
13
13
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1.83
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1.84
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2.5
24
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2
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78
1.05
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19
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60
38
2
0
58
1.13
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2.1
34
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0
140
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28
28
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10
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3
12
0
84
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3.0
40
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0
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22
21
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45
1.81
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19
2.0
19
89
0
58
73
0
5
21
1.02
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6008140--6008202
30
2.1
30
84
0
81
25
14
6
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1.64
6014051--6014103
20
2.7
20
82
8
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35
1
7
54
1.40
6014093--6014137
3
15.7
3
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17
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28
2
0
68
1.01
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3.5
11
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0
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28
2
0
69
1.02
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6.4
23
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142
14
26
24
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1.93
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2.8
43
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131
28
25
19
26
1.98
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1.9
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80
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191
28
25
19
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1.99
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3.5
86
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1
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33
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16
27
1.96
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2.5
170
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426
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21
16
29
1.95
6020366--6020750
172
2.2
173
78
5
404
32
22
16
28
1.96

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          369   370   371   372   373