Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A08
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  123748673

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  43  of  373  ( 44737 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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27
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21
28
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
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(0-2)
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12579784--12580039
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1.8
140
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9
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35
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223
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12.3
27
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5
330
41
8
21
28
1.81
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.79
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24
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16
20
1.79
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2.6
31
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17
20
1.81
12601915--12602080
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13
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21
1.82
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30
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1.83
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20
25
1.66
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
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Entropy
(0-2)
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20
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16
2.1
16
100
0
68
32
41
5
20
1.76
12643818--12643917
44
2.3
43
80
8
114
34
23
18
25
1.96
12646286--12646319
16
2.1
16
88
0
50
35
20
0
44
1.52
12646444--12646613
29
5.8
29
75
8
164
50
13
16
20
1.78
12646444--12646613
89
1.9
89
84
4
227
50
13
16
20
1.78
12646447--12646612
60
2.8
58
84
3
206
50
13
15
20
1.77
12655151--12655217
34
2.0
34
96
0
125
25
16
31
26
1.96
12656264--12656295
16
2.0
16
93
0
55
28
25
15
31
1.96
12658307--12658332
2
13.0
2
100
0
52
50
0
0
50
1.00
12660016--12660228
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2.0
108
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1
329
49
8
8
32
1.64
12662470--12662505
17
2.1
17
94
0
63
52
13
5
27
1.63
12664921--12664980
30
2.0
30
96
0
111
68
18
6
6
1.35
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27
2.1
26
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3
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38
1
5
54
1.34
12673637--12673678
20
2.2
19
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12
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16
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2
57
1.51
12674511--12674543
17
2.0
17
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59
36
15
0
48
1.45
12674824--12675095
46
6.0
46
88
2
370
21
23
14
40
1.90
12680115--12680146
3
10.7
3
93
0
55
68
3
0
28
1.04
12680952--12681000
17
2.8
16
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14
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57
0
8
34
1.29
12682698--12682809
44
2.5
44
97
0
206
25
30
23
20
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
12682900--12682936
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2.8
13
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0
56
64
0
16
18
1.29
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74
2.2
74
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3
235
39
19
17
23
1.92
12683066--12683098
17
1.9
17
93
0
57
66
6
12
15
1.42
12682916--12683316
165
2.5
160
82
10
467
36
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18
26
1.94
12683087--12683247
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35
17
19
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1.94
12683158--12683341
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2.1
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85
5
248
38
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18
27
1.91
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101
3.0
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10
310
40
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15
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1.89
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2.0
61
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19
20
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1.93
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0
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1.10
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1.9
30
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6
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1.60
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15
2.1
15
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0
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1.80
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0
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0
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0
0.92
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0
0
12
0.55
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19
25
1.98
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48
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47
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23
26
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29
1.99
12719236--12719586
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192
24
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19
27
1.99
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1.8
94
86
0
247
21
28
20
28
1.98
12719377--12719591
94
2.3
93
81
3
243
23
26
20
29
1.99
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20
2.0
20
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10
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35
20
0
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1.52
12721485--12721524
16
2.6
16
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4
55
57
2
10
30
1.45
12722315--12722352
7
5.4
7
100
0
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60
0
13
26
1.33
12734348--12734385
13
2.9
14
84
11
53
36
5
21
36
1.76
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
12737931--12737976
19
2.3
20
96
3
85
23
10
17
47
1.79
12738059--12738096
20
1.9
20
100
0
76
50
2
0
47
1.15
12738082--12738138
28
2.0
28
93
0
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1
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1.26
12739657--12739703
22
2.2
21
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58
36
21
8
34
1.84
12739674--12739752
19
4.2
19
90
9
126
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16
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1.82
12739674--12739746
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2.0
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10
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12740490--12740849
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4.3
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2
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21
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1.99
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1.98
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7
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0
13
0
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12741802--12741851
13
3.8
13
85
15
68
0
14
0
86
0.58

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          369   370   371   372   373