Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A08
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  123748673

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  301  of  373  ( 44737 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
101917335--101917384
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2.8
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2
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1.95
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2.1
36
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0
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18
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0
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4
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150
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3
6
65
1.32
101982732--101982815
18
4.6
19
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26
3
5
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2.4
51
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25
4
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62
1.40
101988927--101988968
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2.5
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3
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2
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4.6
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1.99
102014971--102015151
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30
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102025361--102025394
13
2.6
13
95
0
59
41
0
8
50
1.34
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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24
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2.0
40
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7
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2.0
80
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20
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3.3
22
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10
16
35
1.82
102083296--102083374
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4.2
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126
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20
26
1.97
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4.9
174
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974
33
19
20
27
1.96
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4.1
87
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422
32
18
21
27
1.97
102091255--102091972
175
4.1
174
85
4
570
33
19
19
27
1.96
102092551--102092607
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15
35
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2.1
38
90
9
126
37
10
16
35
1.82
102092551--102092629
19
4.2
19
90
9
126
37
10
16
35
1.82
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2.0
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98
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307
20
15
22
41
1.90
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2.2
79
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4
219
24
13
22
39
1.90
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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24
1.90
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2.2
24
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42
1
0
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1.9
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11
44
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2.0
58
100
0
232
36
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24
22
1.95
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1.9
16
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53
20
0
33
46
1.51
102105767--102105846
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2.2
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12
103
33
0
23
42
1.55
102105788--102105860
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3.8
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73
31
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1.54
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29
28
15
26
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6.6
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205
29
28
15
26
1.96
102119921--102120076
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1.9
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233
29
28
15
26
1.96
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83
12
70
14
6
4
76
1.13
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
102157266--102157351
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73
1.15
102157291--102157350
12
5.2
11
74
9
57
18
5
1
75
1.07
102162659--102162771
47
2.4
48
80
5
115
26
30
17
25
1.98
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26
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27
88
5
86
30
25
11
33
1.91
102183652--102183681
16
1.9
15
93
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51
66
3
10
20
1.35
102186436--102186657
46
4.7
46
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8
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22
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19
27
1.98
102192384--102192425
19
2.2
19
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0
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40
4
14
40
1.67
102195822--102195912
35
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35
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1
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102195952--102196228
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1
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37
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25
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0
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19
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0
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0
0
23
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2
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2
100
0
152
0
0
50
50
1.00
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39
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15
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0
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1.98
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13
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102222792--102222853
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1.77
102233431--102233551
9
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2
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102233413--102233460
19
2.5
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60
2
0
37
1.09
102233413--102233468
19
2.8
20
77
20
64
62
1
0
35
1.06
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
102233455--102233510
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3.1
18
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7
3
19
1.27
102233524--102233631
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1.32
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3.5
28
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27
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2
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1.29
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19
2.2
19
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1
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1.15
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0
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2.0
23
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0
0
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0
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1.09
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23
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1.95
102279792--102279932
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23
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182
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23
18
1.96
102286872--102287011
54
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54
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2
237
35
24
22
17
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2.8
63
77
10
185
29
17
29
23
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
102300655--102301101
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47
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3
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27
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9
33
1.88
102300655--102301096
143
3.1
143
90
1
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30
9
32
1.88
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2.0
25
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102304584--102304851
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6.7
40
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0
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3.6
9
91
0
55
65
0
6
28
1.16

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          369   370   371   372   373