Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A08
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  123748673

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  369  of  373  ( 44737 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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1.13
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13
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15
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1.88
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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121983554--121983624
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2
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122001526--122001568
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2.0
21
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0
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1.26
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2.1
15
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0
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0
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1.25
122024163--122024214
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3.1
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79
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61
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0
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31
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10
50
1.66
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
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Entropy
(0-2)
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0
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2.7
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2.2
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1.21
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2.2
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1.08
122145705--122145744
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2.5
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0
62
57
30
0
12
1.36
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
122153916--122153998
32
2.6
33
88
5
109
21
12
9
56
1.64
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2.1
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0
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57
1.62
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65
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244
40
14
15
29
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32
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32
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0
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34
9
19
36
1.84
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13
5.1
13
76
7
71
33
7
24
34
1.84
122163676--122163741
26
2.5
26
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30
7
25
36
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122164006--122164053
21
2.3
22
79
17
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47
2
2
47
1.25
122167162--122167319
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1.9
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82
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5
34
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122176631--122176655
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11
100
0
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28
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21
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9
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0
0
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23
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50
0
16
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3
7
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0
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0
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0
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20
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29
2.0
29
89
0
89
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10
10
43
1.73
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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23
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60
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1.83
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50
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131
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0
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2.1
22
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83
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4
11
35
1.59
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
122326250--122326296
21
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0
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0
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0
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          369   370   371   372   373