Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A08
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  123748673

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  66  of  373  ( 44737 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
19940233--19940384
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1.04
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Percent
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Percent
Indels
Score
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T
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19981159--19981309
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5.4
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0
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1.04
19981155--19981309
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93
0
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31
31
1.73
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
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Entropy
(0-2)
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2
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2.5
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1.14
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21
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Percent
Indels
Score
A
C
G
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Entropy
(0-2)
20081594--20081634
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29
19
29
22
1.98
20107538--20107673
57
2.4
57
88
2
202
25
16
16
41
1.89
20108040--20108088
21
2.3
21
86
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24
18
18
38
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20117128--20117180
26
2.0
26
100
0
106
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11
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2.0
17
100
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17
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0
0
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0
0
28
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13
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55
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23
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23
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0
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0
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0
0
52
1.00
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3
0
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38
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30
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46
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46
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10
263
28
20
27
23
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
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(0-2)
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49
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1.99
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2.0
43
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29
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25
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24
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25
2.00
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26
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2.0
52
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201
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1.9
30
100
0
114
31
19
17
31
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
20227400--20227525
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2.6
48
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1
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16
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27
1.97
20227400--20227570
48
3.5
48
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148
26
15
28
29
1.96
20227533--20227610
40
2.0
40
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0
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1.9
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41
0
29
29
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28
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1.8
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72
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30
20
17
31
1.96

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          369   370   371   372   373