Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A08
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  123748673

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  202  of  373  ( 44737 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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20
40
1.80
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
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(0-2)
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68338987--68339167
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29
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22
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20
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1.99
68365067--68365324
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1.99
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143
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460
23
21
27
27
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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43
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1.98
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29
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1.98
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0
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1.79
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Score
A
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(0-2)
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31
1.85
68453305--68453578
135
2.0
135
100
0
548
28
13
18
39
1.89
68458922--68458966
16
2.8
16
89
0
63
55
28
4
11
1.54
68460470--68460579
29
3.9
28
76
10
98
28
14
30
27
1.95
68460457--68460568
29
4.0
27
77
10
91
29
14
28
27
1.95
68460470--68460579
56
1.9
58
81
3
134
28
14
30
27
1.95
68466851--68466980
47
2.8
47
85
0
170
33
26
16
23
1.95
68481326--68481503
27
6.6
27
82
3
196
27
15
27
29
1.96
68481323--68481503
82
2.2
81
82
2
220
27
15
27
29
1.96
68483774--68483882
34
3.2
33
79
6
112
29
22
19
28
1.98
68496593--68496656
31
2.1
31
84
0
83
26
21
14
37
1.92
68496849--68497017
25
7.0
23
85
9
214
26
23
21
28
1.99
68496849--68497017
49
3.5
47
85
8
216
26
23
21
28
1.99
68496871--68497016
23
6.1
23
87
7
202
27
22
21
28
1.99
68497063--68497133
20
3.5
20
92
0
115
32
19
12
35
1.90
68497068--68497122
11
5.4
11
70
16
55
30
20
12
36
1.90
68498376--68498453
27
2.9
27
81
7
95
21
19
21
37
1.95
68498491--68498935
27
16.4
27
75
9
146
36
9
17
36
1.82
68498447--68498708
81
3.2
79
71
13
199
32
9
18
40
1.83
68498494--68498723
81
2.8
82
73
9
202
33
8
18
39
1.81
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
68498675--68498931
54
4.7
54
74
8
182
37
8
17
35
1.82
68498658--68498935
81
3.4
82
70
11
205
37
8
18
35
1.82
68501218--68501337
43
2.8
42
76
7
134
27
23
15
33
1.95
68505569--68505616
22
2.2
22
96
0
87
14
29
31
25
1.95
68511142--68511319
40
4.5
40
88
2
234
25
27
21
25
1.99
68517842--68518052
40
5.3
40
88
4
230
23
20
27
28
1.99
68522047--68522102
28
2.0
29
92
3
96
30
30
14
25
1.95
68522306--68522342
16
2.3
16
95
0
65
5
21
24
48
1.71
68530891--68530942
10
5.1
10
84
11
52
34
0
5
59
1.21
68530890--68530933
22
2.0
22
90
0
70
38
0
4
56
1.20
68541352--68541401
21
2.4
21
80
6
66
20
24
28
28
1.99
68550175--68550395
46
4.7
45
76
9
176
29
19
27
22
1.98
68550180--68550442
140
1.9
141
79
5
300
30
19
26
22
1.98
68554855--68555025
43
4.0
43
75
8
163
24
16
26
32
1.96
68557243--68557287
20
2.2
20
88
0
63
35
11
2
51
1.50
68564078--68564499
27
15.7
27
79
4
235
39
20
7
32
1.81
68564225--68564499
54
5.1
54
79
7
292
42
21
6
29
1.78
68564225--68564502
81
3.4
80
80
3
306
42
21
6
29
1.79
68564510--68564561
27
1.9
27
84
7
70
38
11
15
34
1.83
68564601--68564678
27
2.9
27
73
17
81
37
23
17
21
1.94
68565438--68565507
25
2.8
24
91
4
104
25
25
22
25
2.00
68565437--68565520
25
3.4
24
83
8
98
28
22
22
26
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
68565655--68565746
42
2.2
42
98
0
175
31
15
20
32
1.94
68565770--68565884
31
3.7
31
88
1
169
27
16
25
30
1.97
68568160--68568290
27
4.9
27
91
0
190
28
21
9
41
1.83
68568187--68568354
54
3.1
54
80
3
151
35
22
7
35
1.82
68568115--68568331
81
2.7
81
73
2
220
34
21
7
35
1.83
68568268--68568540
81
3.4
80
83
5
264
40
21
8
29
1.83
68568282--68568517
27
8.8
27
75
5
210
41
20
8
29
1.83
68568553--68568604
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70
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1.83
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27
3.4
27
84
3
114
33
20
26
19
1.96
68569542--68569611
25
2.8
24
86
4
95
27
25
21
25
1.99

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          369   370   371   372   373