Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A08
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  123748673

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  261  of  373  ( 44737 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
88615651--88615701
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Period
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Copy
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Score
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22
26
26
2.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Matches
Percent
Indels
Score
A
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24
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9
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1.77
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
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Score
A
C
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(0-2)
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10
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10
83
2
59
23
5
1
69
1.20
88838424--88838483
16
3.6
16
78
14
59
20
3
0
76
0.92
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21
3.6
19
81
17
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26
2
1
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1.10
88838436--88838513
12
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12
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20
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25
2
1
70
1.07
88838449--88838494
21
2.2
21
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28
2
0
69
1.00
88838437--88838512
34
2.3
34
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2
1
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88841975--88842012
13
2.8
13
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42
0
13
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88844319--88844365
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24
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0
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1.20
88852584--88852630
22
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22
92
3
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10
19
0
70
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88852581--88852631
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2.5
20
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9
21
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2.1
12
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0
50
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0
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1.62
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2.0
83
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0
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88892882--88893080
108
1.8
110
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23
25
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88898444--88898534
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2.1
44
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4
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28
10
10
49
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88898634--88898687
22
2.6
21
80
8
65
12
0
20
66
1.24
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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0
0
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1.94
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26
2.9
25
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21
32
1.83
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365
3.0
364
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0
2009
32
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1.93
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49
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26
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88940606--88940725
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19
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17
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20
0
20
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29
27
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27
2.8
27
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2
89
21
25
21
32
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
88967259--88967344
27
3.2
26
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11
111
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23
38
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5
26
1.50
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2.8
45
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6
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18
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1
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2.9
29
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0
0
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2.6
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0
0
59
0.98

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          369   370   371   372   373