Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A08
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  123748673

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  362  of  373  ( 44737 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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T
Entropy
(0-2)
119937293--119937863
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209
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0
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Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
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22
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31
1.50
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
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Entropy
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1.01
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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7
73
30
0
6
64
1.18
120038195--120038242
17
2.8
17
74
0
60
2
31
4
62
1.26
120038301--120038333
15
2.4
14
90
10
50
51
0
0
48
1.00
120039415--120039536
60
2.0
60
100
0
244
18
19
9
53
1.70
120040261--120040332
29
2.4
29
81
4
81
36
4
15
44
1.66
120040282--120040340
29
2.0
30
90
3
93
32
3
13
50
1.58
120047860--120047916
30
1.9
30
100
0
114
31
15
28
24
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120047890--120048041
46
3.3
46
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3
207
44
13
23
18
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120048131--120048164
13
2.6
13
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0
50
35
0
29
35
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120049241--120049265
13
1.9
13
100
0
50
16
8
20
56
1.65
120049357--120049400
21
2.1
21
100
0
88
31
18
27
22
1.97
120052048--120052414
3
123.7
3
68
13
145
61
3
5
28
1.35
120054284--120054564
75
3.7
76
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5
370
32
18
18
30
1.95
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39
3.0
39
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0
205
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21
21
1.98
120069209--120069234
8
3.2
8
100
0
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50
0
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6
28
1.37
120070173--120070241
17
4.2
16
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3
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60
2
2
33
1.26
120070173--120070257
16
5.7
14
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17
75
60
2
3
34
1.27
120070305--120070356
14
3.8
13
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2
59
67
1
0
30
1.02
120076607--120076696
10
8.5
11
67
19
50
25
0
2
72
0.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
120076647--120076696
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3.0
16
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16
57
26
0
4
70
1.05
120077099--120077193
35
2.7
35
77
11
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42
1
4
52
1.27
120077390--120077462
21
3.5
21
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3
85
30
28
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31
1.89
120078917--120079027
55
2.0
55
96
0
204
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2
5
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1.38
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23
2.0
23
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0
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0
0
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1.00
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4.1
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24
1
0
73
0.91
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2
2
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1.17
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0
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2.0
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100
0
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18
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2.1
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22
1.72
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2.1
17
100
0
72
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22
11
30
1.89
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23
2.1
23
100
0
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14
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25
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1.56
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21
2.4
21
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3
75
40
6
30
24
1.79
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4
16.8
4
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0
125
26
0
25
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1.52
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17
2.3
17
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0
51
53
10
5
30
1.56
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33
2.1
33
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0
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34
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1.75
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8
8.9
8
73
17
57
67
0
2
29
1.04
120145309--120145385
18
4.4
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12
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67
0
2
29
1.04
120145320--120145385
26
2.6
24
81
13
78
69
0
3
27
1.03
120146492--120146517
7
3.7
7
100
0
52
57
0
0
42
0.98
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20
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56
43
0
1
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1.11
120152244--120152284
20
2.0
21
90
4
66
41
0
2
56
1.13
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
120160092--120160159
28
2.4
29
76
11
70
45
19
0
35
1.50
120160882--120160944
7
8.2
8
78
19
55
52
1
0
46
1.10
120167652--120167735
26
3.2
26
96
0
150
36
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4
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1.77
120168646--120168755
47
2.3
47
80
6
125
37
21
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1.92
120169557--120169587
4
7.8
4
92
0
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3
25
0
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1.02
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154
6
25
6
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1.46
120169612--120169642
14
2.2
14
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0
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0
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3
42
1.32
120174492--120174612
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3.1
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2
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20
20
24
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1.97
120176838--120176973
46
3.0
46
90
2
193
22
24
14
38
1.91

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          369   370   371   372   373