Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A08
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  123748673

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  8  of  373  ( 44737 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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22
14
31
31
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
A
C
G
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Entropy
(0-2)
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2349772--2350045
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31
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101
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2.1
14
100
0
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41
24
13
20
1.89
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0.81
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
2426929--2427001
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21
1.88
2437995--2438028
16
2.1
16
88
5
50
52
0
14
32
1.42
2441889--2442002
57
2.0
57
100
0
228
22
29
10
36
1.88
2443472--2443518
20
2.3
21
85
14
71
42
0
10
46
1.38
2443776--2443825
19
2.6
19
81
9
57
28
0
6
66
1.15
2444214--2444269
27
2.1
28
90
6
89
62
14
10
12
1.55
2446670--2446699
7
4.4
7
95
4
53
13
0
0
86
0.57
2452252--2452291
11
3.6
11
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0
53
20
10
10
60
1.57
2456934--2456976
17
2.5
17
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17
54
51
16
18
13
1.77
2459698--2459822
63
2.0
62
98
1
241
36
3
22
38
1.70
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12
2.2
12
100
0
52
0
0
7
92
0.39
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45
2.5
45
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43
18
16
21
1.88
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2.0
40
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0
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20
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1.80
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45
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3
141
19
22
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1.89
2463589--2463861
46
6.0
46
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0
359
20
24
15
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1.91
2463589--2463861
92
3.0
92
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0
404
20
24
15
39
1.91
2465997--2466058
23
2.8
22
79
18
67
56
8
0
35
1.29
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
2466003--2466047
20
2.3
19
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3
63
55
6
0
37
1.26
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23
2.4
21
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12
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50
9
3
36
1.54
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70
2.0
70
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0
257
38
9
6
45
1.63
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24
2.5
23
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15
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44
4
3
47
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2
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50
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0
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0
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0
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1.9
30
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0
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20
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1.97
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1.96
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2.0
31
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0
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2.8
23
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4
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41
21
10
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1.86
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29
2.5
26
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1
4
54
1.29
2526263--2526320
29
2.0
30
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3
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41
1
5
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1.34
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0
0
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2.2
26
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0
0
51
1.00
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40
0
6
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1.8
286
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36
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19
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18
0
0
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16
83
18
0
0
81
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7.0
10
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19
0
0
80
0.70
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118
1.8
118
91
0
354
23
17
31
27
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
2545663--2545725
24
2.6
24
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12
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39
1
0
58
1.07
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20
2.2
20
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8
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48
7
0
43
1.30
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2.1
68
100
0
290
49
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22
1.70
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21
2.1
21
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0
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0
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25
100
0
106
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13
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2.1
22
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0
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5.9
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17
55
71
0
0
28
0.87

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          369   370   371   372   373