Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A08
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  123748673

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  360  of  373  ( 44737 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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50
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23
1.89
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Percent
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Percent
Indels
Score
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3.9
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15
1.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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Entropy
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Indices
Period
Size
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Number
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A
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119458356--119458501
29
5.3
27
73
15
102
32
2
0
65
1.09
119458362--119458501
7
21.4
7
71
19
72
32
2
0
65
1.10
119458420--119458504
44
1.9
45
85
7
120
34
2
0
63
1.07
119458882--119458916
18
1.9
18
88
0
52
17
0
8
74
1.06
119459811--119459881
28
2.6
27
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10
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45
16
8
29
1.77
119478926--119478976
13
3.9
13
78
0
66
31
5
25
37
1.80
119478927--119478976
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26
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0
73
32
4
26
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119488800--119488833
16
2.1
17
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47
0
0
52
1.00
119499021--119499062
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18
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2
11
9
1.12
119504278--119504591
105
3.0
105
81
1
317
35
12
21
30
1.90
119506912--119506983
21
3.5
19
77
11
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47
1
0
51
1.09
119507204--119507235
13
2.5
13
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0
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25
9
21
1.82
119526571--119526612
3
14.0
3
100
0
84
66
0
0
33
0.92
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1.9
107
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31
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18
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1.97
119538134--119538172
21
1.9
19
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0
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19
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16
1.56
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2.0
21
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1.55
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69
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0
161
21
53
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15
1.69
119546719--119546774
28
2.0
28
85
0
76
46
0
0
53
1.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.7
23
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63
0
0
36
0.95
119554208--119554278
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2.3
31
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2
0
36
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100
0
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0
25
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124
2.0
125
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2
381
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24
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51
0
8
40
1.33
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20
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2
0
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1.13
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0
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3.0
126
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0
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0
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59
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0
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0
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0
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0
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0
0
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23
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50
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30
1.84
119607128--119607280
62
2.4
63
89
4
227
18
10
41
30
1.84
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
119612135--119612217
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2.0
41
100
0
166
42
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19
1.78
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17
2.0
19
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0
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0
7
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19
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1
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0
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2.5
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14
59
23
2
4
69
1.18

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          369   370   371   372   373