Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A08
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  123748673

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  303  of  373  ( 44737 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
102651142--102651299
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25
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1.77
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
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C
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T
Entropy
(0-2)
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2.0
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1.8
129
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1.9
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174
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1
0
44
1.17
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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Entropy
(0-2)
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0
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1.9
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2
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0
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21
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0
7
63
1.21
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
102837496--102837577
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4
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2.0
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0
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1.72
102851176--102851241
35
1.9
34
90
6
107
46
13
7
31
1.71
102863956--102863995
19
2.1
19
85
0
53
37
5
2
55
1.35
102864250--102864305
28
2.1
26
83
12
69
23
1
3
71
1.11
102864260--102864303
19
2.3
18
82
17
54
22
2
2
72
1.07
102864491--102864515
2
12.5
2
100
0
50
52
0
0
48
1.00
102866614--102866651
19
2.0
19
100
0
76
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0
10
42
1.38
102867763--102867934
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4.0
43
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15
158
25
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25
33
1.96
102870455--102870514
25
2.4
25
85
0
75
48
21
13
16
1.80
102873180--102873799
309
2.0
309
98
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8
18
31
1.81
102874370--102874418
25
2.0
25
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0
62
38
0
16
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1.48
102874391--102874433
16
2.6
17
78
17
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0
13
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1.44
102877443--102877498
27
2.2
26
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6
87
39
3
7
50
1.47
102879200--102879246
24
2.1
22
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14
53
34
2
6
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1.36
102881362--102881402
21
2.0
21
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0
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1.54
102883009--102883040
16
2.0
16
100
0
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2.0
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0
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12
1.64
102894596--102894621
3
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100
0
52
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0
0
0.93
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29
4.2
29
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16
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1
7
27
1.30
102901140--102901185
15
2.9
15
90
6
65
67
0
6
26
1.15
102901150--102901215
15
4.5
15
81
14
75
63
0
7
28
1.21
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
102901145--102901303
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1.9
84
81
9
196
60
1
8
30
1.34
102901627--102901667
5
8.0
5
86
5
55
65
14
0
19
1.26
102901624--102901667
15
2.9
15
86
3
61
65
13
0
20
1.26
102902363--102902591
40
5.5
39
64
18
106
18
23
20
37
1.94
102902097--102903137
84
12.2
84
88
3
1284
19
24
21
35
1.96
102902454--102902586
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3.1
43
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20
107
18
24
20
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1.95
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2.0
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1.95
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29
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1.96
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115
28
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17
30
1.97
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2.1
26
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99
0
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11
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2.0
22
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2
12
31
1.51
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47
4.0
48
81
8
196
23
17
28
30
1.97
102913701--102913754
23
2.5
23
82
8
60
61
7
0
31
1.24
102913970--102914078
29
3.8
28
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23
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63
2
8
25
1.36
102913949--102914078
15
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14
71
17
63
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2
7
25
1.32
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0
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0
0
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0
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3
31
0
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1.08
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100
0
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0
0
0.92
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14
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14
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18
56
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3
41
1.50
102929569--102929603
17
2.1
17
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54
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5
8
14
1.29
102935262--102935313
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2.0
26
96
0
95
50
17
19
13
1.78
102936180--102936527
71
4.9
71
76
3
315
34
19
22
24
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
102936180--102936522
142
2.4
142
80
0
391
34
18
21
24
1.96
102936180--102936561
142
2.7
142
77
3
387
34
18
22
24
1.96
102939574--102939758
79
2.3
82
83
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229
24
27
22
24
2.00
102939555--102939758
40
5.1
40
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229
24
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22
25
2.00
102941439--102941470
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0
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0
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4.7
50
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297
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1.99
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27
4.2
27
82
3
111
16
23
23
36
1.94

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          369   370   371   372   373