Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A08
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  123748673

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  220  of  373  ( 44737 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.94
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36
20
1.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
A
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1.86
75062494--75062662
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220
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1.94
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3.6
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2
97
16
27
35
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1.94
75067991--75068040
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1.93
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27
77
2
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20
6
30
1.77
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
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Entropy
(0-2)
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1.77
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1
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42
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1.77
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22
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1.77
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1.87
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18
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1.81
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31
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115
17
18
13
49
1.80
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
75078900--75079150
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9.3
27
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1
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20
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92
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1.84
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0
187
29
19
8
42
1.80
75078952--75079177
81
2.8
81
76
4
231
38
22
8
30
1.84
75079131--75079316
81
2.3
81
79
3
216
29
19
8
42
1.80
75079135--75079317
54
3.4
54
81
4
226
30
18
8
43
1.79
75079557--75079608
27
2.0
26
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17
26
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1.9
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32
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20
1.96
75096437--75096607
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93
92
0
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22
1.99
75096429--75096598
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45
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10
200
28
30
20
21
1.98
75099361--75099437
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2.3
33
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0
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1.94
75103286--75103432
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43
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176
31
23
17
27
1.97
75105539--75105689
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53
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4
214
29
27
16
25
1.97
75112301--75112694
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47
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0
576
26
30
9
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1.89
75112433--75112557
25
5.2
25
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18
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28
8
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1.87
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30
1.92
75118145--75118295
53
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53
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205
29
28
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1.97
75122243--75122364
43
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43
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15
28
1.94
75124039--75124188
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3.6
41
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10
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23
21
27
28
1.99
75126153--75126177
8
3.1
8
100
0
50
24
24
0
52
1.48
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
75133229--75133385
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3.7
42
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4
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33
23
15
26
1.95
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56
2.0
56
86
0
156
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25
1.90
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21
2.0
21
83
8
54
57
0
4
37
1.19
75154124--75154167
16
2.9
15
83
12
54
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0
0
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1.00
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0
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1.84
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154
2.7
152
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450
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20
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1.98
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50
0
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2.0
183
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0
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15
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1.87
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15
1.9
15
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0
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20
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1.74
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0
2218
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13
13
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1.84
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2.2
547
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0
2246
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13
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1.84
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15
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15
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1
0
51
1.11
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9
18.4
9
70
11
60
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12
1
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1.49
75176148--75176274
17
6.8
18
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19
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48
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0
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75176151--75176202
24
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25
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7
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50
11
0
38
1.39
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34
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127
47
11
0
40
1.45
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87
1.8
87
90
0
255
47
12
1
38
1.53
75176206--75176294
44
2.0
45
82
6
110
48
12
1
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1.48
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14
2.1
14
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34
0
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1.25
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21
2.0
21
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0
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26
19
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0
1.45
75182310--75182405
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2.2
43
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20
27
26
26
1.99
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67
2.8
64
76
8
185
30
17
29
22
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
75192818--75192965
67
2.2
67
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8
176
33
17
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21
1.96
75211515--75211547
6
5.5
6
92
0
57
54
0
45
0
0.99
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21
2.0
21
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11
63
1.48
75219837--75220051
46
4.6
46
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14
151
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20
27
23
1.99
75219788--75220047
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1.9
139
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330
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20
27
23
1.99
75227083--75227164
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2.7
30
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0
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4.6
46
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27
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1
247
25
19
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28
1.99
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49
3.8
48
79
6
223
27
25
19
27
1.99

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          369   370   371   372   373