Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A08
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  123748673

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  201  of  373  ( 44737 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
67913299--67913410
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23
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67913299--67913410
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154
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23
15
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27
1.99
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40
8.6
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2
476
24
20
27
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1.99
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5
44
1.65
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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3
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88
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2.2
21
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2
59
1.44
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.98
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2.7
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92
0
262
24
29
18
27
1.98
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38
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2
46
1.56
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
68073930--68073977
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12
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50
1.00
68084651--68084823
46
3.7
48
80
10
173
27
20
28
22
1.99
68087501--68087540
20
2.0
21
85
5
55
45
12
12
30
1.79
68091033--68091070
19
2.0
19
85
10
51
18
10
0
71
1.14
68099326--68099352
14
1.9
14
100
0
54
14
14
11
59
1.62
68105236--68105578
40
8.6
40
90
2
476
24
20
27
27
1.99
68112633--68112975
40
8.6
40
90
2
476
24
20
27
27
1.99
68117878--68117941
34
1.9
33
84
9
85
23
25
23
28
2.00
68121205--68121317
43
2.7
42
76
2
127
29
26
15
29
1.96
68124539--68124582
21
2.1
21
95
0
79
52
18
0
29
1.46
68130952--68131129
27
6.6
27
84
3
205
29
28
15
26
1.96
68130973--68131128
82
1.9
81
88
3
233
29
28
15
26
1.96
68139054--68139230
27
6.5
27
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3
203
29
27
15
27
1.96
68139074--68139229
82
1.9
81
88
3
233
29
28
15
26
1.96
68145524--68145579
20
2.7
21
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23
23
10
1.85
68145548--68145598
19
2.6
19
87
3
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45
23
23
7
1.79
68149489--68149532
19
2.3
20
80
11
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25
2
6
65
1.28
68155477--68155594
42
2.8
40
74
5
110
33
24
14
27
1.94
68160629--68160672
17
2.6
17
96
0
79
31
15
20
31
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
68161152--68161206
22
2.5
22
90
0
92
43
5
23
27
1.75
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21
1.9
20
89
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28
2
23
46
1.65
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48
3.9
48
93
0
291
27
31
17
23
1.97
68170624--68170681
29
2.0
29
83
6
73
31
25
1
41
1.66
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2.0
29
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3
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15
1
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1.40
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28
2.1
28
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0
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31
15
26
26
1.95
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17
2.0
18
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0
20
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1.11
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1.88
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2.6
47
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0
208
36
13
23
26
1.93
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3.8
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4
230
35
18
24
21
1.95
68204227--68204423
55
3.6
54
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4
236
35
18
24
21
1.96
68204227--68204434
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3.9
54
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4
231
35
18
24
22
1.96
68204235--68204458
108
2.1
109
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2
272
36
18
24
20
1.95
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133
2.0
133
100
0
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16
33
1.92
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11
2.6
11
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5
51
0
10
0
90
0.47
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28
2.0
29
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9
84
15
41
22
20
1.90
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47
94
0
769
29
29
8
32
1.86
68228935--68229013
25
3.3
25
64
10
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31
27
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34
1.82
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7.8
40
94
0
507
25
29
21
23
1.99
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47
11.6
47
92
3
885
29
29
7
33
1.85
68235088--68235625
139
3.9
140
92
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865
29
29
7
33
1.85
68235088--68235625
232
2.3
230
91
2
873
29
29
7
33
1.85
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
68244981--68245012
11
2.9
11
90
0
55
59
0
3
37
1.13
68248642--68248830
50
3.8
49
82
5
218
29
25
17
27
1.98
68248655--68248838
101
1.8
99
84
4
253
28
25
17
27
1.98
68254215--68254357
72
2.0
72
100
0
286
48
7
25
18
1.74
68257944--68258175
49
4.7
49
79
7
261
28
27
19
25
1.99
68257945--68258175
100
2.3
99
82
5
270
28
27
19
24
1.99
68261329--68261393
34
2.0
34
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6
89
30
26
16
26
1.97
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4.2
26
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0
180
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7
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2.7
49
86
1
183
28
27
18
25
1.98
68270576--68270614
19
2.1
19
100
0
78
48
10
0
41
1.37

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          369   370   371   372   373