Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A01
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  115637255

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  1  of  349  ( 41854 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
8702--8750
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2.2
22
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0
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16
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2.0
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0
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0
0
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1
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46422--46475
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1
1
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2.2
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2.0
26
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0
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0
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2.1
30
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0
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21
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28
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2.0
60
100
0
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2.0
23
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2
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1.13
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
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C
G
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2.1
13
100
0
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0
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2.0
20
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5
0
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1.02
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2.0
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12
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12
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528
41
23
12
23
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105685--106190
164
3.0
171
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7
464
44
24
11
18
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2.2
19
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1
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2.1
25
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37
0
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2.6
191
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16
13
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2.1
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0
0
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20
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2
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0
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0
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2
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5
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40
1.74
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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5
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18
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0
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2.2
12
100
0
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29
0
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62
1.22
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0
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32
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0
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27
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20
1.98
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39
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2
194
25
25
18
30
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
275518--275607
31
3.0
29
79
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12
5
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1.63
277216--277259
22
2.0
23
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6
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0
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0
0
0
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0
30
1.58
314697--314730
17
2.0
17
100
0
68
23
23
23
29
1.99
320141--320288
74
2.0
74
97
0
278
44
6
5
43
1.53
324323--324361
18
2.2
18
85
0
51
61
2
23
12
1.43
327460--327507
23
2.1
23
92
0
78
41
10
10
37
1.74
332560--332651
31
3.0
32
75
13
102
19
4
19
56
1.58
334086--334129
23
1.9
23
81
9
54
9
56
9
25
1.59
334840--335388
194
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192
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5
712
26
13
19
40
1.88
337279--337417
72
1.9
72
91
0
224
36
15
20
26
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337582--337634
16
3.3
16
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0
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5
32
20
1.76
337614--337720
45
2.5
43
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11
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33
4
28
33
1.78
337816--337902
19
4.6
20
72
20
53
58
0
0
41
0.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
337826--337858
11
3.0
11
91
8
50
57
0
0
42
0.98
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21
5.1
21
69
21
79
54
0
0
43
1.12
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29
3.2
28
69
16
71
51
3
0
45
1.17
337816--337944
56
2.3
57
81
9
156
53
3
0
43
1.16
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77
2.0
77
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0
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8
8
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1.66
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53
2.0
54
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1
207
58
14
20
5
1.56
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16
2.4
16
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8
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28
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13
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1.88
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17
2.5
18
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2
2
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1.08
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8
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0
128
15
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2.1
16
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0
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2
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1.50
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2.1
24
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0
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49
9
1
39
1.47
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1.9
17
88
11
50
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0
3
33
1.10
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12
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16
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1.74
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137
2.8
143
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9
384
29
7
16
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1.75
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145
4.8
145
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27
8
16
47
1.75
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287
2.4
284
79
7
733
28
8
16
46
1.76
387878--389008
431
2.7
416
79
9
1202
28
8
16
47
1.75
392424--392500
4
19.0
4
73
7
57
25
2
23
48
1.64
394297--394342
16
2.9
16
87
9
58
67
2
28
2
1.14
394513--394861
189
1.9
178
83
9
450
30
20
10
37
1.87
395173--395210
4
9.8
4
94
5
69
52
21
0
26
1.47
395487--395545
30
1.9
31
89
3
93
25
16
32
25
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
401240--401309
34
2.1
34
100
0
140
47
2
27
22
1.66
405646--405690
23
2.0
23
82
8
56
37
13
8
40
1.76
408494--408536
22
2.0
22
90
0
68
20
4
11
62
1.46
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12
2.9
12
91
4
52
91
0
8
0
0.43
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14
2.2
14
94
0
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0
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29
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2.3
18
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4
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45
12
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2.0
15
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0
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23
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1.75
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17
2.3
18
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4
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45
12
5
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2.1
15
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0
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29
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8
3.4
8
100
0
54
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0
0
33
0.92

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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