Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A01
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  115637255

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   

This is table  275  of  349  ( 41854 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
91807660--91807700
19
2.2
19
100
0
82
14
14
14
56
1.69
91812760--91812837
29
2.8
28
82
7
95
25
34
16
23
1.95
91812758--91812837
28
2.8
28
81
7
99
25
33
17
23
1.96
91816133--91816258
46
2.7
46
93
0
216
30
29
20
19
1.97
91818492--91818611
56
2.1
56
96
0
222
45
9
22
22
1.80
91819740--91819922
79
2.3
81
84
7
232
24
22
27
25
2.00
91819741--91819924
40
4.6
40
83
9
216
23
22
28
25
2.00
91819793--91819957
79
2.1
79
84
6
210
25
21
27
25
1.99
91826405--91826524
56
2.1
56
98
0
231
45
9
23
22
1.81
91827652--91827834
79
2.3
81
84
7
232
24
22
27
25
2.00
91827653--91827836
40
4.6
40
83
9
216
23
22
28
25
2.00
91827705--91827869
79
2.1
79
84
6
210
25
21
27
25
1.99
91833783--91833911
48
2.8
45
86
9
158
30
25
15
28
1.96
91833924--91834047
37
3.4
37
89
4
189
25
28
18
28
1.98
91834266--91834307
19
2.3
19
95
4
77
33
11
14
40
1.82
91838147--91838235
20
4.4
20
77
4
90
39
20
30
10
1.85
91839336--91839376
4
10.2
4
94
0
73
0
26
0
73
0.84
91841766--91841797
12
2.7
12
100
0
64
56
9
15
18
1.66
91843693--91843749
29
2.0
29
100
0
114
38
21
15
24
1.92
91843809--91843881
28
2.6
28
84
0
92
35
20
10
32
1.88
91849886--91849954
36
1.9
36
96
0
129
30
11
33
24
1.91
91850349--91850420
36
2.0
36
100
0
144
27
13
25
33
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
91855267--91855525
45
5.9
45
79
8
266
22
17
28
31
1.97
91864215--91864277
30
2.1
30
87
0
90
53
14
3
28
1.56
91864315--91864353
11
3.5
11
78
0
51
56
7
15
20
1.63
91866849--91866940
40
2.3
40
87
5
125
25
21
26
27
2.00
91869179--91869235
22
2.6
22
75
10
62
26
28
22
22
1.99
91871729--91871802
29
2.6
29
89
4
105
25
16
32
25
1.96
91877090--91877131
21
2.0
21
85
0
57
40
14
7
38
1.73
91879524--91879557
3
11.7
3
93
6
61
70
0
0
29
0.87
91882580--91882620
20
2.1
20
86
4
57
60
4
0
34
1.18
91896765--91896809
22
2.0
22
100
0
90
35
8
0
55
1.31
91901545--91901588
22
2.0
22
95
0
79
36
6
22
34
1.81
91906320--91906378
30
2.0
30
90
6
93
33
8
11
45
1.71
91912391--91912574
67
2.8
64
76
8
185
29
17
30
22
1.97
91915586--91915835
68
3.8
65
75
9
215
24
28
16
31
1.96
91916032--91916113
42
2.0
42
100
0
164
45
13
2
39
1.57
91924140--91924192
20
2.7
20
93
0
88
66
0
3
30
1.10
91927220--91927249
15
2.0
15
100
0
60
40
26
6
26
1.81
91929098--91929163
22
3.0
22
95
0
114
31
7
22
37
1.82
91930665--91930709
23
2.0
23
90
0
72
35
15
17
31
1.92
91938223--91938272
25
2.0
25
100
0
100
24
32
4
40
1.73
91939837--91939874
19
2.0
19
100
0
76
36
5
21
36
1.76
91944056--91944113
30
1.9
30
100
0
116
51
20
17
10
1.74
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
91945745--91945794
24
2.1
24
100
0
100
54
12
10
24
1.67
91949207--91949333
38
3.3
38
87
0
182
18
18
26
37
1.93
91951112--91951262
75
2.0
75
96
0
275
47
16
5
30
1.71
91959865--91959908
22
2.0
22
86
0
61
45
2
4
47
1.35
91963204--91963315
27
4.2
26
86
5
134
36
23
23
16
1.94
91963204--91963315
54
2.1
54
86
3
154
36
23
23
16
1.94
91969750--91969861
27
4.2
26
88
5
134
34
23
24
17
1.96
91969750--91969861
54
2.1
54
86
3
154
34
23
24
17
1.96
91986235--91986260
6
4.3
6
100
0
52
84
0
0
15
0.62
91994302--91994448
42
3.4
42
78
7
143
32
23
17
26
1.96
92006249--92006289
15
2.5
17
88
11
59
21
0
2
75
0.92
92008774--92008820
19
2.5
19
89
6
69
19
21
14
44
1.86
92013915--92014166
88
2.9
88
90
0
405
27
23
21
27
1.99
92013943--92014170
44
5.2
44
68
6
183
28
23
22
25
1.99
92014184--92014522
133
2.5
133
78
4
369
30
16
23
29
1.97
92018913--92018967
10
5.6
10
72
12
51
0
14
7
78
0.96
92018967--92019000
16
2.2
15
89
5
50
23
5
0
70
1.09
92030039--92030097
28
2.1
29
84
9
77
54
3
13
28
1.55
92035409--92035562
57
2.7
58
78
6
152
32
20
19
27
1.97
92036151--92036202
22
2.3
23
81
12
63
28
0
1
69
0.99
92036945--92036979
12
2.8
12
91
4
52
80
8
8
2
1.01
92042048--92042219
93
1.8
93
93
0
299
29
29
20
20
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
92042041--92042216
46
3.8
46
78
12
198
30
28
20
20
1.98
92042090--92042228
47
3.0
46
74
16
135
30
28
18
22
1.97
92044904--92045021
46
2.6
46
86
2
157
27
22
15
34
1.94
92046095--92046165
32
2.2
32
95
2
126
42
21
7
29
1.79
92049263--92049380
46
2.6
46
86
2
157
27
22
15
34
1.94
92052292--92052351
30
2.0
30
90
0
93
60
13
1
25
1.43
92054116--92054156
20
2.0
20
90
0
64
31
4
2
60
1.30
92054827--92055002
46
3.8
46
76
12
189
21
19
28
30
1.98
92057588--92057624
20
1.9
18
89
10
56
35
21
0
43
1.53
92060394--92060600
46
4.6
44
79
10
170
23
30
20
25
1.99
92060437--92060645
46
4.6
44
75
11
163
22
31
19
26
1.98
92063540--92063576
20
1.9
18
89
10
56
35
21
0
43
1.53
92064643--92064669
9
3.0
9
100
0
54
22
0
0
77
0.76
92066443--92066467
13
1.9
13
100
0
50
48
4
0
48
1.20
92078894--92078952
16
3.6
16
81
9
66
55
5
0
38
1.22
92083508--92083586
37
2.1
38
84
9
101
60
0
0
39
0.97
92083513--92083570
17
3.2
17
74
11
53
67
0
0
32
0.91
92088121--92088159
18
2.0
20
90
9
64
46
12
0
41
1.42
92089386--92089415
15
2.0
15
93
0
51
46
3
20
30
1.66
92093169--92093224
23
2.4
23
81
0
67
16
23
17
42
1.88
92096224--92096265
15
2.8
15
92
0
66
38
7
4
50
1.51
92098102--92098155
27
2.0
27
100
0
108
18
3
11
66
1.37
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
92100488--92100543
16
3.1
19
72
27
66
42
1
7
48
1.41
92103302--92103343
21
2.0
21
100
0
84
33
23
14
28
1.94
92106255--92106306
26
2.0
26
88
0
77
42
19
23
15
1.89
92111660--92111780
46
2.6
46
82
12
140
29
19
27
23
1.98
92111756--92111869
44
2.7
41
85
8
133
23
17
29
28
1.97
92111801--92111879
40
2.0
40
94
0
140
25
18
30
25
1.98
92111841--92111969
49
2.7
47
85
3
150
27
20
27
24
1.99
92118579--92118636
31
1.9
29
82
6
71
39
3
5
51
1.41
92118644--92118708
26
2.5
27
80
14
75
50
0
1
47
1.10
92119475--92119517
13
3.3
13
93
0
68
51
2
4
41
1.35
92120076--92120191
58
2.0
61
86
8
168
42
3
2
51
1.32
92120081--92120211
58
2.2
61
81
10
155
42
3
3
50
1.36
92122248--92122304
23
2.5
22
80
5
69
71
10
7
10
1.29
92129517--92129793
50
5.5
50
90
0
419
35
14
22
27
1.93
92129773--92129831
31
1.9
31
96
0
109
28
18
25
27
1.98
92129786--92129877
46
2.0
46
86
0
130
26
21
23
28
1.99
92129833--92129901
31
2.2
31
84
0
84
26
20
26
27
1.99
92149069--92149135
20
3.3
20
78
12
75
40
14
28
16
1.88
92151084--92151108
13
1.9
13
100
0
50
16
4
0
80
0.87
92151077--92151109
6
5.5
6
89
10
50
15
3
0
81
0.80
92156169--92156206
19
1.9
19
85
15
51
42
7
26
23
1.81
92157326--92157355
12
2.5
12
94
0
51
23
0
3
73
0.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
92158338--92158392
18
3.2
17
77
10
58
5
30
0
63
1.17
92159618--92159733
28
4.2
28
86
2
164
17
24
21
37
1.94
92161886--92161982
48
2.0
48
97
0
185
27
23
16
31
1.96
92180255--92180444
46
4.0
46
83
5
218
28
26
16
27
1.97
92180257--92180436
94
1.9
96
88
4
274
27
26
17
27
1.98
92181433--92181478
13
3.5
13
80
16
51
10
6
4
78
1.08
92182409--92182460
20
2.5
20
78
9
61
61
15
1
21
1.43
92184182--92184247
34
1.9
34
96
0
123
33
18
24
24
1.97
92187656--92187699
22
1.9
23
86
9
63
15
9
13
61
1.56
92194930--92195041
56
2.0
57
91
1
181
22
24
10
42
1.85

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349