Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A01
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  115637255

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  6  of  349  ( 41854 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
1859358--1859396
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0
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0
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0
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2.0
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46
1.72
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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19
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1932207--1932249
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45
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2.0
25
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0
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2.1
21
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4
56
1.20
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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G
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Entropy
(0-2)
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197
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21
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1
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22
5
4
67
1.30
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2.3
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2.1
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2074210--2074311
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48
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0
3
56
1.18
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
2074226--2074392
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0
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0
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76
18
51
60
2
0
37
1.09
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20
3.1
20
77
13
56
51
0
0
48
1.00
2074966--2075004
13
2.9
13
88
7
60
61
2
0
35
1.10
2074966--2075004
14
2.9
14
92
3
62
61
2
0
35
1.10
2074950--2075045
21
4.5
20
70
11
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58
2
0
39
1.10
2074954--2075075
64
1.9
63
83
8
158
56
2
0
40
1.18
2075034--2075124
22
3.8
23
79
13
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50
3
1
45
1.25
2075040--2075104
16
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16
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13
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53
3
1
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1.25
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9
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9
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0
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0
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10
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2
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1.37
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0
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2
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1.37
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5
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5
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39
0
0
60
0.96
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14
2.9
14
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18
52
37
0
0
62
0.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
2091652--2091700
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2.3
22
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3
82
38
0
0
61
0.96
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16
3.3
15
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40
0
0
59
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14
2.7
14
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15
0
47
1.45
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6.0
8
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10
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0
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18
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0
0
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0
0
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9
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9
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0
0
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20
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1.98
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20
26
1.98
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29
20
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1.99
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2.0
214
79
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20
22
25
1.98
2117438--2117462
8
3.1
8
100
0
50
88
0
0
12
0.53
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
2118209--2118257
18
2.8
18
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34
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0
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1.29
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14
2.1
15
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36
0
13
50
1.42
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40
2.5
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7
104
22
19
17
40
1.92
2124371--2124482
41
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18
19
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29
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0
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1.50
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5.1
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4
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26
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32
0
1
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1.02
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30
2.4
30
73
2
70
32
21
21
24
1.98

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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