Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A01
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  115637255

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  259  of  349  ( 41854 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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Indices
Period
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Consensus
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Percent
Indels
Score
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1.79
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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Entropy
(0-2)
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20
22
28
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20
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1.99
86308495--86308639
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45
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24
26
16
32
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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24
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1.97
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459
24
24
18
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175
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1.96
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3.9
13
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5
68
7
7
0
84
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86325782--86325832
19
2.6
20
82
17
63
7
7
0
84
0.78
86331976--86332033
22
2.6
22
84
7
73
43
17
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36
1.66
86332012--86332084
19
3.9
19
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123
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15
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1.80
86331989--86332084
19
4.9
19
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10
106
38
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37
1.78
86332015--86332093
36
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108
39
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11
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1.79
86332015--86332092
19
4.3
19
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1.80
86334333--86334404
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1
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1.40
86334332--86334414
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1
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32
1.36
86334378--86334420
22
2.1
19
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0
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30
1.21
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0
0
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0.93
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86364113--86364165
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2.0
30
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0
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49
1.62
86369332--86369433
40
2.6
40
87
7
138
25
27
22
24
2.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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20
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4
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11
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27
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31
1.35
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44
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0
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178
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0
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1.99
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1.99
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20
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1.97
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1.98
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1.96
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23
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1.87
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1.9
181
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1.82
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26
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0
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1.85
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0
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26
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104
20
21
21
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86410492--86410550
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2.7
22
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20
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22
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1.98
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27
2.8
27
85
6
89
17
24
21
36
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
86410906--86411092
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86410968--86411033
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2.7
24
90
2
96
18
19
13
48
1.81
86410906--86411092
85
2.2
85
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0
329
19
17
14
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1.82
86410906--86411113
30
7.1
30
80
11
207
19
17
14
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86416095--86416682
294
2.0
294
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0
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1.60
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0
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0
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1.11
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29
5.3
29
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10
120
61
1
3
33
1.23

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349