Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A01
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  115637255

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  278  of  349  ( 41854 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
92866327--92866368
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20
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27
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26
1.99
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1.9
119
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28
22
22
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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23
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20
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17
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1.68
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28
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1.99
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28
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1.99
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4.1
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122
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27
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1.99
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4.4
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82
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23
1.94
92978909--92978996
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3.9
23
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101
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22
25
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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20
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1.76
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2.1
26
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2
25
1.25
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
93048469--93048508
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19
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25
20
27
25
1.99
93061195--93061331
48
2.9
47
80
6
161
25
18
32
23
1.97
93061153--93061331
94
1.9
94
83
4
236
26
18
30
24
1.98
93075836--93075865
15
2.0
15
93
0
51
26
3
26
43
1.70
93078386--93078456
30
2.4
30
92
0
115
15
39
28
16
1.89
93089455--93089500
6
7.7
6
100
0
92
17
0
15
67
1.24
93093712--93093758
22
2.1
22
100
0
94
31
36
8
23
1.85
93094951--93095005
13
4.6
12
78
17
60
10
14
1
72
1.19
93102401--93102589
104
1.8
105
88
1
290
41
2
15
40
1.59
93107004--93107173
39
4.3
39
86
5
218
25
21
28
24
1.99
93106951--93107173
79
2.8
78
82
6
236
26
21
27
25
1.99
93107031--93107206
78
2.3
79
82
5
198
26
21
28
23
1.99
93114930--93115100
39
4.3
39
85
6
202
25
21
28
25
1.99
93114877--93115100
79
2.8
79
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7
222
25
20
27
25
1.99
93114957--93115133
79
2.2
80
80
4
191
25
21
28
24
1.99
93116478--93116569
25
3.7
25
81
8
91
33
22
18
25
1.97
93118133--93118157
10
2.5
10
100
0
50
36
0
0
64
0.94
93122852--93122902
25
2.0
25
96
0
93
21
3
21
52
1.62
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
93123430--93123572
43
3.3
43
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1
207
21
18
31
27
1.97
93125395--93125439
23
2.0
23
82
8
56
6
15
2
75
1.11
93125951--93126135
63
2.9
62
81
3
210
26
20
27
26
1.99
93128806--93128839
17
2.0
17
94
0
59
50
0
0
50
1.00
93136843--93137269
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4.5
95
80
2
342
27
15
18
38
1.91
93136913--93137281
95
3.9
94
81
3
375
27
15
18
37
1.92
93139816--93139861
22
2.0
24
87
8
69
34
0
17
47
1.48
93141973--93142011
20
1.9
20
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51
30
2
15
51
1.57
93144311--93144344
10
3.4
10
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0
50
50
26
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14
1.72
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2.2
21
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7
60
42
4
6
46
1.48
93153797--93153951
42
3.7
42
82
3
186
29
16
24
29
1.96
93153788--93153951
85
1.9
84
81
6
197
30
15
23
29
1.96
93157493--93157547
24
2.3
25
76
17
62
52
3
3
40
1.36
93159688--93159733
18
2.6
18
92
0
74
17
30
32
19
1.95
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36
1.9
36
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0
131
27
10
10
52
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93164303--93164460
46
3.5
44
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8
151
27
29
18
24
1.98
93164433--93164603
46
3.7
47
74
10
154
22
28
19
29
1.98
93164430--93164600
94
1.8
92
87
2
252
22
28
18
29
1.98
93168177--93168241
28
2.2
28
83
8
76
50
4
13
30
1.62
93168938--93168977
15
2.7
15
85
14
57
60
0
7
32
1.25
93170758--93170789
3
10.7
3
100
0
64
65
0
0
34
0.93
93171675--93171733
27
2.2
27
87
6
84
28
10
30
30
1.90
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
93173367--93173453
45
1.9
45
86
4
122
41
12
20
25
1.88
93175859--93176104
38
6.0
38
74
15
204
31
24
14
29
1.94
93175866--93176104
85
2.8
85
92
0
406
30
25
14
29
1.94
93189492--93189753
39
6.7
40
87
8
321
25
27
22
25
2.00
93194279--93194460
40
4.6
39
80
10
190
25
28
21
24
1.99
93194279--93194460
79
2.3
80
79
8
192
25
28
21
24
1.99
93202667--93202731
33
2.0
33
100
0
130
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24
1.98
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15
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1.96
93202924--93203195
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5.7
47
71
16
204
27
16
29
26
1.97
93210364--93210518
43
3.6
43
72
11
147
25
18
23
32
1.97

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
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          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349