Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A01
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  115637255

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  23  of  349  ( 41854 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6284582--6284616
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15
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0
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0
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0
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1.30
6284582--6284628
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0
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2.8
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6291017--6291109
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18
90
0
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0
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2.9
26
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22
2.5
22
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20
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26
1.9
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5
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6321263--6321378
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2.6
44
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2
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4.8
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20
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130
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20
20
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1.9
217
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21
22
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2.6
131
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4
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20
22
22
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0
0
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1.9
28
85
14
74
51
5
3
38
1.44
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6335746--6335791
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2.1
23
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15
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21
2.1
21
82
0
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52
4
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1.54
6337718--6337749
15
2.1
15
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0
55
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12
0
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3.8
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4
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6340119--6340163
11
4.1
11
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8
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22
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1.72
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18
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20
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2.0
36
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2.7
105
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14
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2.2
12
100
0
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7
0
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1.14
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2.2
86
82
1
262
36
15
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1.89
6353635--6353798
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1.9
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1
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13
2.3
13
100
0
60
23
6
6
63
1.43
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18
2.7
18
100
0
96
60
4
0
35
1.16
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2.0
38
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20
1.79
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16
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16
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1.00
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18
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0
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1.10
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17
2.1
16
88
5
50
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8
0
29
1.26
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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38
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3.4
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50
1
0
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1.11
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0
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2.0
17
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52
54
0
0
45
0.99
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20
155
48
5
2
43
1.38
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120
2.4
120
90
2
446
48
4
1
44
1.34
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20
2.0
19
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5
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0
2
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0
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0
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16
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16
20
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2.8
20
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0
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3
12
19
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1.42
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15
4.8
15
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3
65
5
12
20
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1.51
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11
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30
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0
115
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3
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7
0
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0
0
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2.2
47
82
12
120
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0
2
56
1.21
6402475--6402551
21
3.4
21
79
13
82
41
0
3
54
1.19
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6402483--6402562
13
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13
70
25
52
40
0
3
56
1.17
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2.5
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14
107
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0
1
60
1.05
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21
2.6
21
91
5
83
38
0
1
59
1.08
6402628--6402669
21
2.0
21
86
9
59
42
0
0
57
0.99
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14
2.7
15
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4
53
38
0
2
58
1.12
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22
2.6
23
81
10
66
56
3
1
38
1.27
6403000--6403080
24
3.4
24
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14
87
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3
1
41
1.27
6403011--6403102
47
2.0
47
85
8
125
53
3
1
42
1.24
6403091--6403125
10
3.7
9
88
11
52
77
0
0
22
0.78
6403016--6403114
47
2.1
46
78
9
103
57
2
1
39
1.17
6411175--6411205
15
2.1
15
100
0
62
35
6
6
51
1.53
6413627--6413732
51
2.1
51
100
0
212
31
13
17
37
1.88
6415036--6415061
12
2.2
12
100
0
52
38
0
0
61
0.96
6416875--6416917
5
8.6
5
80
10
52
76
0
23
0
0.78
6420671--6420713
20
2.2
20
83
8
52
51
0
13
34
1.42
6423312--6423342
16
1.9
16
93
0
53
87
12
0
0
0.55
6425524--6425563
20
2.0
20
85
5
53
77
5
12
5
1.09
6428324--6428440
40
2.9
40
92
0
189
33
15
29
21
1.94
6428388--6428976
112
5.3
112
93
1
950
25
19
29
26
1.98
6428405--6428976
223
2.6
222
93
1
957
25
19
28
26
1.99
6429588--6429613
12
2.2
12
100
0
52
38
7
34
19
1.80
6429999--6430199
84
2.4
83
90
4
321
33
19
17
29
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6431182--6431221
11
3.7
11
90
3
64
35
10
27
27
1.89
6434109--6434179
21
3.4
21
80
0
79
33
18
45
2
1.64
6434490--6434876
42
9.2
42
86
2
429
26
20
21
31
1.98
6443228--6443371
38
3.7
38
88
3
200
22
22
24
29
1.99
6450260--6450289
12
2.5
12
100
0
60
43
6
13
36
1.70
6455511--6455540
11
2.7
11
100
0
60
53
0
0
46
1.00
6462561--6462604
22
2.0
22
82
8
54
56
4
6
31
1.46
6462675--6462708
17
2.0
17
88
0
50
61
8
8
20
1.52
6477283--6477326
22
2.0
22
82
8
54
56
2
6
34
1.38
6478883--6478955
38
1.9
38
91
0
119
10
2
38
47
1.53
6479895--6479969
37
2.0
37
89
0
114
45
8
10
36
1.68
6481752--6481830
27
3.2
27
62
29
66
27
30
18
22
1.98
6481728--6481850
47
2.6
47
96
0
219
28
30
19
21
1.97
6488074--6488118
23
2.0
23
95
0
81
40
0
11
48
1.39
6492456--6492575
51
2.4
51
92
0
195
39
12
21
26
1.89
6499065--6499348
129
2.2
127
85
2
372
25
19
17
37
1.94
6499749--6499784
18
1.9
19
88
5
56
33
19
13
33
1.91
6501083--6501137
29
1.9
28
88
3
83
61
3
7
27
1.39
6502144--6502184
21
2.0
21
95
0
73
0
56
21
21
1.43
6506813--6506858
24
1.9
24
95
0
83
60
8
13
17
1.56
6507770--6507854
21
4.0
20
71
10
53
45
38
1
14
1.52
6508061--6508119
7
8.4
7
76
0
55
42
38
1
16
1.59
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6508220--6508254
15
2.4
14
81
9
52
34
42
0
22
1.54
6508294--6508323
14
2.1
14
100
0
60
56
23
0
20
1.42
6508487--6508524
14
2.7
14
87
0
58
57
18
0
23
1.40
6508482--6508532
14
3.7
14
77
12
52
52
25
0
21
1.47
6508758--6509132
156
2.4
155
80
4
382
29
20
21
29
1.98
6514088--6514112
7
3.6
7
100
0
50
24
0
0
76
0.80
6527467--6527591
43
2.9
43
86
2
180
28
32
25
13
1.94
6527584--6527667
38
2.2
38
89
0
123
29
26
22
21
1.99
6533853--6533890
19
2.0
19
85
10
51
21
26
13
39
1.89
6536171--6536209
10
3.9
10
86
0
51
51
2
2
43
1.29

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
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          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349