Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A01
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  115637255

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  36  of  349  ( 41854 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
10123443--10123513
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2.8
26
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2
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10123431--10123514
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2
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2.0
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24
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2.9
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2.0
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39
4.5
39
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4
221
31
3
19
45
1.67
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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30
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2.0
22
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2.0
22
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18
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3.5
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1
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2.0
29
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2.0
20
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2.0
22
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0
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40
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10229458--10229509
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40
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2.8
28
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0
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24
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22
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3.6
34
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14
10
34
1.80
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.1
22
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2
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2.0
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18
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54
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42
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2
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1
14
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28
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29
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1.9
16
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6
53
23
0
6
70
1.11
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
10311157--10311214
28
2.2
28
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32
0
1
65
1.03
10311716--10311822
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3.4
33
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0
11
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17
16
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9.2
44
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1
549
32
15
27
25
1.95
10332502--10332795
132
2.2
132
85
2
403
32
17
16
33
1.92
10332922--10333155
130
1.8
130
84
1
326
27
20
18
33
1.96
10336221--10336298
27
2.9
27
94
0
129
25
29
24
20
1.99
10345893--10345927
15
2.4
14
86
9
52
71
2
5
20
1.19
10346423--10346470
14
3.4
14
78
16
53
66
8
2
22
1.29
10347625--10347931
147
2.1
148
95
1
546
34
20
10
35
1.86
10347966--10348029
31
2.0
32
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25
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26
1.78
10349410--10349544
62
2.2
62
84
0
189
22
24
29
22
1.99
10349522--10349557
13
2.8
13
87
4
56
2
33
47
16
1.61
10351754--10351802
26
2.0
24
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8
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4
0
32
1.13
10351789--10351831
21
2.0
22
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20
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10354292--10354410
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15
29
1.95
10354297--10354426
40
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40
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4
165
30
21
15
32
1.94
10357589--10357655
21
3.2
21
74
2
73
26
23
26
22
2.00
10359377--10359415
13
2.7
15
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15
55
53
10
5
30
1.56
10360439--10360477
20
2.0
20
100
0
78
10
17
25
46
1.80
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
10368281--10368344
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2.0
32
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3
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60
15
3
20
1.48
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20
2.0
20
100
0
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31
19
9
39
1.84
10379388--10379424
16
2.4
17
82
17
53
62
2
0
35
1.10
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18
2.9
16
80
19
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59
2
0
38
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2.1
29
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1
25
1.13
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11
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0
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1.78
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1.86
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1.94
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76
1
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18
1.00
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5.4
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20
29
1.98
10429307--10429426
46
2.6
47
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2
197
28
20
20
30
1.98
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20
2.8
20
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0
76
37
19
10
32
1.86
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2.0
34
100
0
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5
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17
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66
2
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1.22
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26
2.0
24
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64
6
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30
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68
4
0
26
1.08
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5.0
6
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0
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20
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1.78
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2.0
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211
22
29
20
27
1.99
10467680--10467789
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3.1
35
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5
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13
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1.93
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70
2.3
70
84
0
198
31
12
24
31
1.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
10467692--10467855
35
4.7
34
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3
175
31
13
23
31
1.93
10467953--10468040
31
2.8
31
91
0
140
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21
29
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1.99
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5
100
0
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0
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2.0
43
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0
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2.1
19
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0
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1.59
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7
6.6
7
92
2
74
28
11
44
15
1.81

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349