Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A01
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  115637255

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  158  of  349  ( 41854 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.68
Indices
Period
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Copy
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Percent
Indels
Score
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101
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18
24
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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20
28
25
1.99
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316
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20
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1.99
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3.7
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82
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262
25
20
28
25
1.99
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31
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29
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1.85
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29
1.87
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1.98
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0
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2.0
14
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0
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0
57
1.38
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
51173391--51173568
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3.3
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3
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29
15
27
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1.9
81
84
1
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16
27
1.97
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27
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27
1.96
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203
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15
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51191237--51191280
11
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11
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8
63
79
2
0
18
0.83
51191237--51191280
15
2.7
15
86
13
61
79
2
0
18
0.83
51195332--51195369
12
3.2
12
92
0
58
18
21
31
28
1.97
51212284--51212316
3
11.0
3
100
0
66
0
0
33
66
0.92
51217166--51217256
13
7.2
12
75
18
69
63
1
4
30
1.21
51217167--51217237
17
4.2
17
72
15
58
60
0
5
33
1.20
51217202--51217266
19
3.8
17
75
13
62
66
1
3
29
1.16
51217198--51217260
24
2.7
23
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11
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1
3
28
1.16
51219344--51219424
33
2.4
35
75
10
87
30
23
17
28
1.97
51219735--51219787
26
2.0
26
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7
63
20
15
22
41
1.89
51221041--51221135
12
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12
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13
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22
36
7
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1.82
51221042--51221142
24
4.2
24
92
0
148
20
37
5
35
1.77
51221811--51221841
15
2.1
15
100
0
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19
19
29
32
1.96
51227620--51227672
26
2.0
26
85
7
72
20
16
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39
1.92
51228929--51229050
24
5.0
24
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1
181
22
38
5
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1.78
51228934--51229026
12
7.8
12
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9
55
23
38
4
33
1.75
51244411--51244526
55
2.1
55
82
6
137
24
26
30
18
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
51253656--51253696
18
2.3
18
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0
73
26
41
17
14
1.88
51259708--51259767
30
2.0
30
90
0
93
58
16
1
23
1.47
51261162--51261194
13
2.4
14
90
5
50
39
0
3
57
1.14
51271783--51271836
24
2.2
26
86
6
76
18
0
5
75
0.98
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16
2.5
17
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11
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9
12
14
1.52
51276920--51277030
44
2.5
43
88
7
161
26
21
29
22
1.99
51278251--51278302
23
2.3
24
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9
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38
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15
28
1.90
51282909--51282978
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28
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12
27
32
1.93
51287309--51287478
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4.1
42
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192
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26
18
20
1.96
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3.9
42
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7
215
34
27
19
19
1.95
51287309--51287491
83
2.2
84
82
8
223
34
25
19
19
1.96
51288202--51288258
28
2.0
28
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6
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14
10
24
1.73
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41
3.5
41
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130
36
23
17
21
1.95
51296545--51296593
25
2.0
25
87
0
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14
10
38
1.80
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46
3.7
46
73
4
144
30
27
20
22
1.98
51312236--51312403
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1.8
92
89
3
268
28
29
20
22
1.98
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6.7
40
84
6
272
25
28
21
25
1.99
51339919--51340129
79
2.7
80
85
4
268
25
28
21
25
1.99
51339919--51340182
79
3.3
80
81
8
247
25
28
21
25
1.99
51339955--51340182
119
1.9
121
80
8
270
25
28
21
25
1.99
51340114--51340191
40
1.9
41
82
10
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26
28
20
24
1.99
51347300--51347563
40
6.7
40
84
6
272
25
28
21
25
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
51347300--51347510
79
2.7
80
85
4
268
25
28
21
25
1.99
51347300--51347563
79
3.3
80
81
8
247
25
28
21
25
1.99
51347336--51347563
119
1.9
121
80
8
270
25
28
21
25
1.99
51347495--51347572
40
1.9
41
82
10
97
26
28
20
24
1.99
51358740--51358813
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3.4
22
66
11
62
17
27
31
24
1.97
51358739--51358822
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2.0
43
95
0
150
21
26
29
22
1.99
51358956--51359032
38
2.1
37
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2
136
33
20
19
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1.96
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2.6
26
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27
1.93
51360500--51360594
28
3.4
28
89
2
129
32
28
12
26
1.93
51368789--51368939
28
5.4
28
92
1
223
33
28
11
25
1.92

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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