Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A01
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  115637255

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  7  of  349  ( 41854 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
2135380--2135777
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131
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100
0
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100
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39
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78
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2.3
26
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2
93
8
0
30
61
1.26
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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10
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1.20
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26
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12
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2.1
16
100
0
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36
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2.4
18
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0
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9
1.34
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38
2.4
38
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1.80
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2.2
20
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19
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20
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10
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1.8
132
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0
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17
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3
21
1.11
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12
3.6
12
81
3
52
68
0
2
29
1.02
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
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Entropy
(0-2)
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0
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12
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1.82
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44
22.2
44
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17
31
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436
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2
1608
29
17
31
21
1.96
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38
2.3
38
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0
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4.5
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11
0
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3
1
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1.20
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11
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1
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51
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3
30
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5
125
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15
3
40
1.63
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
2238295--2238351
19
3.1
19
77
12
64
59
0
0
40
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0
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20
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51
35
5
12
46
1.65
2246431--2246537
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50
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11
119
35
15
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1
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0
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44
1.25
2268173--2268209
15
2.4
15
95
4
65
45
5
10
37
1.62
2273522--2273579
30
1.9
30
89
0
89
31
18
12
37
1.88
2279659--2279692
17
2.0
17
88
0
50
35
0
0
64
0.94
2280172--2280209
20
2.0
20
94
5
69
42
7
0
50
1.31
2285822--2285968
76
1.9
76
89
5
226
34
9
9
46
1.69
2292186--2292218
13
2.6
13
85
4
50
75
6
9
9
1.18
2302725--2302759
14
2.6
14
95
4
63
42
0
0
57
0.99
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25
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23
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18
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32
0
0
67
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8
3.8
8
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0
0
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33
0
0
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2303980--2304008
15
1.9
15
100
0
58
31
0
0
68
0.89
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21
2.0
21
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9
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40
0
0
59
0.97
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29
1.9
30
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10
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42
1
10
45
1.49
2315159--2315207
25
2.0
24
92
7
82
32
8
4
55
1.48
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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22
2.2
21
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10
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75
4
0
20
0.97
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23
2.1
22
85
11
62
66
2
2
29
1.14
2318672--2318883
109
1.9
109
89
3
329
33
15
4
47
1.64
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20
2.0
20
94
0
69
20
7
10
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1.52
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2.6
12
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0
0
70
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3
100
0
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0
31
0
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0.89
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15
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42
0
0
57
0.99
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2.5
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2
1
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2.4
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0
105
28
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10
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1.80
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20
2.8
20
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29
3
1
64
1.20
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16
1.9
18
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30
0
3
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1.06
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2.1
19
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10
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62
0
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0
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0
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15
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6
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42
0
0
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0
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14
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51
0
0
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1.00
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0
1
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1.08
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37
2.3
34
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10
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44
0
1
54
1.08
2361431--2361465
15
2.2
16
90
5
54
45
2
0
51
1.16
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23
2.7
20
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63
15
3
17
1.45
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29
2.3
29
100
0
136
54
2
17
25
1.57
2378458--2378572
44
2.6
44
85
2
149
35
13
22
27
1.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
2378458--2378591
46
3.0
45
82
4
153
35
14
23
26
1.93
2384506--2384539
18
1.9
18
94
5
61
61
5
0
32
1.20
2393122--2393191
27
2.7
26
86
4
95
60
5
4
30
1.39
2393236--2393285
26
1.9
26
84
8
66
54
0
8
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1.30
2395144--2395201
22
2.7
21
79
15
57
18
6
5
68
1.31
2402491--2402542
24
2.3
21
81
15
59
57
0
1
40
1.10
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17
5.3
18
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16
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1
1
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0
0
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1.00
2407275--2407370
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21
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1
2
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1.20
2413082--2413118
19
1.9
19
94
0
65
32
18
18
29
1.96

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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