Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A01
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  115637255

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  2  of  349  ( 41854 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
425918--425963
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2.1
22
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0
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0
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0
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0
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2.6
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1.90
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7
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37
38
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2.0
46
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0
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2
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21
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3
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21
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443280--443321
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2.3
238
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2.0
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2.0
166
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16
2.0
17
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5
59
36
12
0
51
1.39
464075--464119
18
2.5
20
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17
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8
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96
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19
20
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0
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0
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2.0
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2
20
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1.9
102
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2
280
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10
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483798--483861
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2.0
32
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0
110
31
15
28
25
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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69
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2.5
21
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0
97
20
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1.49
489813--489862
25
2.0
25
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0
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490070--490105
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2.0
18
100
0
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11
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2.0
59
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7
22
25
1.79
498857--498971
30
3.8
30
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0
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22
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2.2
13
100
0
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11
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2.2
117
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21
16
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528623--528839
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117
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1
301
27
21
15
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533165--533206
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1.9
22
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20
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26
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2.0
21
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21
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2.0
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90
0
64
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21
29
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553761--553800
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42
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2.0
21
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10
0
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130
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1.9
171
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0
530
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16
17
26
1.90
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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14
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0
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27
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0
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0
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2.0
20
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53
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0
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91
36
14
4
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2.2
29
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0
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3
38
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291
17
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1.99
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3.1
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0
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18
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19
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203
27
28
22
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1101
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14
15
39
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689136--689175
14
2.9
14
81
11
55
65
2
2
30
1.19
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
689548--689583
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17
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5
0
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1.25
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2.1
23
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0
0
54
1.00
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16
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0
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12
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2.0
55
96
0
204
38
9
11
40
1.73
735895--736123
123
1.9
123
87
3
336
22
13
22
41
1.89
739858--739931
6
12.3
6
95
0
67
33
10
48
6
1.64
739873--739932
6
10.0
6
98
0
111
33
15
50
1
1.54
745584--745651
31
2.2
31
86
0
91
50
8
8
32
1.64
754759--755026
135
2.0
135
96
0
500
30
26
21
21
1.99
756793--756831
19
2.1
19
100
0
78
30
15
5
48
1.66
757916--757956
2
20.5
2
89
0
64
46
0
4
48
1.23
757916--757956
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3.4
12
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0
73
46
0
4
48
1.23
759261--759317
29
2.0
29
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0
96
43
19
14
22
1.86
765309--765351
16
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17
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13
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55
0
0
44
0.99
765309--765357
18
2.8
18
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11
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57
0
0
42
0.99
767556--767593
16
2.4
16
90
0
58
31
0
34
34
1.58
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
767572--767666
45
2.1
44
88
1
136
34
5
27
32
1.79
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18
2.0
17
88
5
52
54
0
0
45
0.99
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27
2.7
27
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8
76
52
2
0
45
1.15
767975--768009
18
2.0
17
88
5
52
54
0
0
45
0.99
767747--768021
147
1.9
149
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1
500
46
2
2
47
1.32
767995--768173
54
3.1
54
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20
135
48
7
2
41
1.43
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2.0
17
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5
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0
0
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17
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0
0
53
1.00
767959--768250
120
2.4
119
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2
469
50
4
2
43
1.35
782597--782640
22
2.0
22
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27
2
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1.23
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2
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2
100
0
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0
0
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1.00
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14
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788660--788724
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2.2
30
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36
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36
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0
128
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5
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1.70
792515--792608
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37
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5
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15
11
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30
2.2
30
88
0
103
36
4
21
36
1.74
796919--796979
30
2.1
30
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3
88
34
4
21
39
1.75
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30
2.7
31
79
7
87
51
6
7
35
1.55
806886--806923
10
3.8
10
89
0
58
7
21
2
68
1.28
807844--807899
19
3.1
18
79
10
69
50
1
0
48
1.11
808187--808272
41
2.1
41
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2
156
55
9
1
33
1.39
818708--818764
17
3.4
16
73
20
53
66
1
1
29
1.12
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
824620--824644
13
1.9
13
100
0
50
20
8
16
56
1.65
829194--829306
27
4.2
26
86
5
136
36
22
23
17
1.95
829194--829306
54
2.1
54
86
3
156
36
22
23
17
1.95
835454--835495
8
5.5
8
80
8
52
9
4
0
85
0.72
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44
15.4
44
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2
962
22
31
16
29
1.96
836419--836638
88
2.5
88
91
0
343
28
28
16
26
1.97
836487--836634
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3.3
46
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18
132
31
28
16
23
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2.0
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7
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15
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2.0
51
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154
10
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849138--849162
13
1.9
13
100
0
50
84
0
0
16
0.63

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349