Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A01
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  115637255

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  80  of  349  ( 41854 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
23782075--23782184
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37
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0
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21
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28
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1.8
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0
290
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22
28
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1.99
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4.1
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13
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17
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0
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20
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2.0
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0
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117
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100
0
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200
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2.8
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18
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2
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48
2.8
48
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149
31
2
21
45
1.64
23853912--23854042
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2.3
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2
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45
1.64
23855700--23855868
46
3.7
46
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15
186
21
20
28
28
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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15
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9
19
12
1.61
23858391--23858438
15
3.2
15
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53
56
14
16
12
1.68
23862359--23862431
28
2.6
29
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96
10
17
13
57
1.64
23862359--23862435
15
5.3
15
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97
10
18
12
58
1.62
23864777--23864946
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1.8
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1
306
21
21
28
27
1.99
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25
2.2
26
78
9
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53
0
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39
1.28
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1
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8
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1.86
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1.51
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3.4
21
75
11
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45
32
0
21
1.53
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3.1
14
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9
54
31
47
0
20
1.50
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15
9.1
15
69
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54
47
32
2
17
1.61
23875124--23875246
7
16.6
7
72
13
50
48
30
2
17
1.60
23875155--23875198
21
2.1
21
91
0
70
50
29
2
18
1.59
23875138--23875193
7
7.9
7
76
11
51
51
30
1
16
1.54
23875264--23875337
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2.1
35
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48
22
1
27
1.59
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16.9
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87
3
763
23
25
21
29
1.99
23875399--23876112
122
5.8
122
82
3
808
22
25
21
30
1.99
23883745--23883781
2
18.5
2
94
0
65
54
0
45
0
1.00
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0.99
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12
92
4
56
8
2
2
86
0.76
23888471--23888498
3
9.3
3
100
0
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32
32
0
35
1.58
23888733--23888793
27
2.3
26
82
5
77
32
11
3
52
1.54
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
23888734--23888797
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2.2
29
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31
10
3
54
1.51
23890270--23890394
46
2.7
46
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0
187
21
20
27
30
1.98
23895484--23895547
20
3.2
20
82
2
85
32
7
9
50
1.64
23895625--23895667
18
2.4
18
92
0
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44
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0
51
1.22
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2.0
39
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39
18
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31
1.84
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2.2
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13
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16
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55
46
0
0
53
1.00
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1.22
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24
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2
72
1.06
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2.7
27
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28
5
1
64
1.22
23918203--23918405
9
20.9
10
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4
1
61
1.25
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29
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28
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102
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1
0
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1.11
23918321--23918427
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10
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1
0
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1.11
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25
2.0
25
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36
20
6
36
1.78
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26
28
22
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1.99
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25
27
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23
2.00
23952295--23952360
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1.9
35
87
9
100
39
1
1
57
1.17
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
23952792--23952858
35
1.9
35
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0
107
44
10
7
37
1.67
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43
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0
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25
19
26
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26
1.85
23965462--23965623
81
2.0
81
98
0
315
45
17
13
22
1.84
23970015--23970108
3
31.7
3
73
16
54
64
5
3
26
1.30
23970062--23970109
18
2.7
19
87
9
66
68
4
0
27
1.07
23973172--23973250
28
2.8
28
82
0
104
30
27
8
32
1.87
23977001--23977038
20
1.9
20
88
0
58
71
2
0
26
1.00
23977001--23977048
20
2.4
20
82
6
53
68
2
2
27
1.11
23979090--23979137
23
2.1
23
96
0
87
35
20
16
27
1.94
23979881--23980336
46
9.8
48
80
9
383
27
18
28
26
1.98
23979884--23980336
94
4.8
95
80
10
450
27
17
28
26
1.98
23979884--23980334
185
2.4
186
82
7
497
27
17
28
26
1.98
23982260--23982961
233
3.0
233
95
1
1246
38
19
13
29
1.89
23983506--23983534
13
2.1
14
93
6
51
72
6
6
13
1.26
23985718--23985775
6
9.5
6
92
3
98
81
0
0
18
0.70
23985714--23985791
12
6.1
14
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13
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78
1
0
20
0.83
23985721--23985782
15
3.9
17
76
16
71
79
0
0
20
0.74
23992769--23992887
29
4.2
30
74
8
106
28
27
13
30
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
23995678--23995720
20
2.2
20
91
0
68
34
20
32
11
1.89
23997632--23997801
93
1.8
93
92
0
286
27
28
21
22
1.99
23997625--23997800
46
3.8
46
78
10
196
28
28
21
21
1.99
23997676--23997819
46
3.1
47
73
18
131
30
27
19
22
1.98
24001463--24001618
42
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41
75
17
158
24
18
26
30
1.98
24008787--24008942
42
3.7
41
75
17
158
24
18
26
30
1.98
24012305--24012527
40
5.6
39
83
3
223
26
28
20
24
1.99
24020216--24020438
40
5.6
40
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3
236
26
28
20
24
1.99
24032173--24032328
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3.7
42
79
0
159
29
17
25
27
1.97
24032173--24032328
84
1.9
84
84
0
213
29
17
25
27
1.97
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2.8
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10
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30
16
22
30
1.96
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4.7
35
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3
177
42
18
8
31
1.80
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37
1.9
38
83
8
96
38
35
6
19
1.78
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13
2.0
13
100
0
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15
30
30
23
1.95
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2.3
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8
102
34
5
7
52
1.52
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35
2.1
35
100
0
150
34
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21
1.92
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14
2.1
14
93
0
51
36
6
10
46
1.64
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15
3.5
15
82
15
61
24
24
10
42
1.85
24060419--24061197
205
3.8
205
90
1
1150
30
18
20
29
1.97
24063118--24063212
42
2.3
41
82
8
111
33
5
7
53
1.51
24066770--24066824
28
2.0
28
85
7
76
38
23
7
30
1.82
24066954--24067023
27
2.5
28
86
4
88
18
24
22
34
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
24066954--24067034
27
2.9
28
81
3
74
20
25
19
33
1.97
24066934--24067048
55
2.1
56
80
8
128
20
23
20
35
1.96
24068113--24068146
10
3.3
10
84
8
50
29
8
8
52
1.62
24079125--24079202
40
2.0
40
89
0
120
35
33
14
16
1.89
24081412--24081519
26
4.2
26
93
0
189
32
7
24
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1.83
24083005--24083057
26
2.0
26
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7
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39
20
15
24
1.91
24086001--24086196
39
5.0
39
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207
18
20
27
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2.0
13
100
0
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2.0
40
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0
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38
30
11
19
1.87
24099280--24099318
20
1.9
20
84
5
51
20
17
35
25
1.95

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
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          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
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          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349