Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A01
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  115637255

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  348  of  349  ( 41854 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
114839054--114839117
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32
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0
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28
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2.5
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0
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1.9
17
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0
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Indices
Period
Size
Copy
Number
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Percent
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Percent
Indels
Score
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120
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2.0
20
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2
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1.12
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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Entropy
(0-2)
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1.9
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114
43
29
4
23
1.74
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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20
1.78
115082542--115082588
21
2.2
22
92
3
78
21
19
38
21
1.94
115117743--115117772
15
2.0
15
100
0
60
40
20
0
40
1.52
115123058--115123122
32
2.0
32
93
0
112
43
13
10
32
1.79
115129951--115130018
27
2.5
27
95
0
127
32
11
33
22
1.90
115131844--115131899
12
4.5
12
79
16
60
42
1
1
53
1.21
115131841--115131886
5
8.8
5
83
7
56
43
0
2
54
1.12
115133214--115133252
18
2.1
19
90
4
62
41
0
10
48
1.37
115133227--115133274
23
2.0
24
84
4
62
41
0
12
45
1.42
115140812--115141434
111
5.8
102
87
5
521
18
23
21
35
1.95
115140995--115141542
111
4.9
111
87
1
672
19
23
20
35
1.96
115140893--115141434
222
2.5
213
87
3
717
18
23
21
36
1.95
115140893--115141528
333
1.9
324
81
5
740
19
23
21
35
1.96
115141354--115141626
111
2.5
110
82
3
314
23
24
17
33
1.97
115143092--115143122
15
2.1
15
93
0
53
16
0
9
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1.07
115143124--115143170
24
2.0
22
88
8
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29
8
14
46
1.74
115143126--115143179
24
2.2
22
76
20
54
33
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14
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1.78
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12
2.2
12
100
0
54
77
0
0
22
0.76
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22
2.0
22
90
0
68
13
16
13
55
1.69
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
115146485--115146547
30
2.1
30
96
0
117
26
3
12
57
1.51
115146670--115146700
11
2.8
11
90
0
53
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0
0
32
0.91
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11
3.1
11
91
4
52
65
0
0
34
0.93
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30
3.9
30
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1
198
26
23
6
42
1.79
115149951--115150058
15
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15
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22
7
44
1.79
115154632--115154755
30
4.1
30
93
1
203
25
24
6
43
1.78
115154642--115154749
15
7.2
15
67
12
78
25
22
7
44
1.79
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2.0
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0
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0
30
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2.0
20
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0
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10
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1.48
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27
2.0
28
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7
74
26
0
5
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1.12
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2.0
15
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0
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3
0
30
1.07
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2.0
29
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12
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3
0
33
1.12
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11
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4
50
73
0
26
0
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2.8
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25
0
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18
2.2
19
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12
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29
24
0
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21
2.8
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24
13
1.93
115183871--115183951
21
3.7
23
80
9
80
37
25
22
14
1.93
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3.5
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2
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51
11
0
37
1.37
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13
2.2
13
100
0
56
0
14
7
78
0.95
115185205--115185252
25
2.0
25
84
11
66
2
16
6
75
1.11
115189102--115189135
5
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5
93
6
59
17
0
0
82
0.67
115189102--115189136
16
2.2
16
100
0
70
17
0
0
82
0.66
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
115197730--115197904
85
2.0
89
94
5
313
30
13
14
42
1.83
115197738--115197904
89
1.9
84
93
6
262
31
13
14
40
1.85
115200902--115201062
81
2.0
79
95
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288
41
11
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8
1.73
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88
6.6
90
75
4
464
27
16
26
29
1.97
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263
2.0
263
95
0
938
27
16
26
29
1.97
115205806--115206328
132
4.0
132
95
0
931
27
16
26
29
1.97
115206304--115206820
133
3.9
133
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1
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1.98
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189
27
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29
1.98
115206431--115206759
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7.3
46
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12
200
25
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1.98
115207759--115207787
12
2.3
13
94
5
51
79
0
13
6
0.93

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349