Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A01
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  115637255

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  64  of  349  ( 41854 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
18734988--18735164
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196
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
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2.7
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0
1
64
1.02
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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Entropy
(0-2)
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60
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2.3
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2.0
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18884127--18884166
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45
0
2
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1.14
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1.9
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20
1.66
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
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Entropy
(0-2)
18920098--18920587
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19
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0
36
1.48
18925497--18925641
63
2.3
63
92
0
245
46
17
0
36
1.48
18929446--18929543
45
2.2
45
83
3
126
41
20
17
20
1.90
18931129--18931170
20
2.2
19
87
12
59
57
4
0
38
1.20
18931158--18931188
5
6.4
5
92
7
55
58
0
0
41
0.98
18934479--18934832
43
8.3
43
81
1
381
29
17
25
27
1.98
18934479--18934824
171
2.0
172
85
2
473
29
17
25
27
1.98
18943592--18943663
33
2.1
35
84
5
94
45
16
8
29
1.76
18946369--18946402
17
1.9
18
88
5
52
70
8
5
14
1.31
18946596--18946639
15
3.0
14
83
9
52
63
2
4
29
1.26
18946596--18946640
18
2.6
18
89
3
65
62
2
4
31
1.27
18949213--18949244
11
2.8
12
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50
34
0
0
65
0.93
18949371--18949427
30
1.9
30
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0
105
56
14
3
26
1.54
18951957--18951983
4
6.8
4
100
0
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0
0
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0.76
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2
14.0
2
100
0
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0
0
50
1.00
18968327--18968366
17
2.4
17
87
4
55
32
0
0
67
0.91
18980513--18980549
14
2.6
14
86
0
56
70
5
5
18
1.27
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
18982321--18982361
21
2.0
21
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9
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0
51
19
29
1.47
18987902--18987936
18
1.9
18
88
0
52
34
0
14
51
1.42
18988069--18988170
9
11.4
9
68
21
63
36
1
15
46
1.58
18988074--18988200
16
8.1
16
70
16
86
38
3
14
44
1.61
18988429--18988515
40
2.1
41
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2
113
65
9
2
22
1.33
18988870--18989339
99
4.8
99
94
1
802
51
3
6
37
1.47
18992317--18992341
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2.1
12
100
0
50
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20
1.76
18993531--18993709
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76
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20
20
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1.97
18994912--18994946
15
2.3
15
90
0
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0
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31
1.18
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0
53
54
0
45
0
0.99
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2.0
37
100
0
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10
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2.2
19
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40
0
5
55
1.22
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2.2
20
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0
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40
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24
1.84
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4.4
20
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17
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41
3
2
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1.29
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16
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0
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45
0
2
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1.16
19023567--19023605
21
2.0
19
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56
5
0
38
1.22
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17
2.4
17
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0
71
20
22
12
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1.84
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3
10.0
3
92
0
51
33
3
0
63
1.11
19042562--19042622
22
2.6
24
79
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72
39
1
1
57
1.18
19042584--19042623
15
2.5
16
84
8
55
35
2
0
62
1.09
19044128--19044173
20
2.2
21
84
7
58
69
6
6
17
1.32
19045834--19045869
17
2.1
17
89
0
54
30
2
5
61
1.33
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
19046041--19046082
15
2.8
16
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13
54
69
0
0
30
0.89
19046049--19046103
21
2.6
22
82
5
60
61
1
0
36
1.06
19046470--19046509
16
2.5
16
88
8
55
10
55
2
32
1.47
19060237--19060269
13
2.4
14
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10
50
78
0
3
18
0.87
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13
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13
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0
17
1.49
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22
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96
35
45
0
19
1.51
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3
73
20
59
30
3
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1.17
19060795--19060877
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18
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19063709--19063755
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2.5
19
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27
21
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42
1.81
19067335--19067438
53
2.0
52
83
5
129
20
14
11
53
1.71

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349