Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A01
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  115637255

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  66  of  349  ( 41854 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
19289017--19289093
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40
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0
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136
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1.9
21
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0
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2
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27
2.5
27
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4
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2
20
38
1.68
19315956--19316031
17
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15
59
39
2
19
38
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19319421--19319513
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2.9
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78
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5.4
52
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25
15
25
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35
79
6
221
26
15
26
32
1.95
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3.3
15
75
15
52
43
28
11
16
1.83
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33
2.4
33
91
0
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39
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10
20
1.85
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18
3.4
18
76
13
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41
31
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18
1.81
19320034--19320093
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2.7
22
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0
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35
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18
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19322715--19322757
22
2.0
22
90
0
68
44
23
6
25
1.78
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.9
16
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0
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19
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16
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1.76
19336716--19336760
23
2.0
22
82
4
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33
2
2
62
1.20
19337525--19337569
6
7.5
6
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19344140--19344165
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2.0
13
100
0
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15
30
38
15
1.88
19350161--19350219
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19
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1
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1.05
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4
93
0
50
70
0
5
23
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89
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287
28
18
20
33
1.95
19351652--19352683
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610
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19
17
33
1.95
19351824--19352435
89
6.8
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73
10
346
29
20
16
33
1.95
19352394--19352634
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2.5
96
87
0
329
28
21
17
33
1.95
19351811--19352665
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550
29
20
16
33
1.95
19352713--19352825
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2.6
44
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2
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19359333--19359377
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2.0
23
82
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37
8
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40
1.76
19361165--19361213
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2.0
24
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19361138--19361377
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24
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20
15
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1.94
19375218--19375325
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2.0
53
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0
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19375335--19375364
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15
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0
0
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13
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11.0
4
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10
61
73
0
2
23
0.94
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2.2
18
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51
27
0
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3.9
106
84
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537
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1
15
51
1.52
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
19382030--19382430
210
1.9
209
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682
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1
14
51
1.52
19382038--19382472
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10
405
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1
14
52
1.51
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19
2.1
19
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1.30
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19
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17
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3.5
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15
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1.95
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2.1
20
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2.0
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1.70
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2.1
21
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1.95
19457257--19457573
132
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128
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327
24
28
15
31
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
19471862--19472019
42
3.7
43
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7
142
24
21
24
29
1.99
19471904--19472024
43
2.9
42
78
2
134
23
19
25
31
1.98
19478481--19478527
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21
1.94
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50
0
32
0
68
0.90
19493179--19493203
3
8.3
3
100
0
50
68
0
0
32
0.90
19493692--19493731
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96
0
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10
0
45
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1.9
22
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0
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50
2
7
40
1.43
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28
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29
75
15
72
46
2
0
50
1.16
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2.8
176
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0
746
28
18
22
29
1.98
19522739--19522798
23
2.7
22
84
5
68
38
1
1
58
1.18
19526060--19526110
21
2.5
21
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50
7
1
39
1.42
19526446--19526472
12
2.2
12
100
0
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7
0
22
1.12
19527005--19527049
22
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21
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4
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2
0
46
1.13
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26
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10
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4
9
44
1.59
19527725--19527773
22
2.1
23
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7
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2
2
44
1.24
19535485--19535514
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8
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0
0
23
0.78
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24
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23
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32
6
0
61
1.22
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28
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27
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1
0
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1.00
19536743--19536825
27
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28
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32
1
0
66
1.00
19538152--19538228
39
2.0
39
100
0
154
29
28
2
38
1.70
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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76
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8
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16
2.4
16
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0
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35
0
25
38
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31
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3
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41
15
12
31
1.84
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13
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13
100
0
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0
0
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2
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11
24
22
1.88
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23
2.4
21
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17
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40
0
0
59
0.98
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23
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0
0
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1.60
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14
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5
157
21
17
15
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1.85
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1.9
61
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1
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1.74
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2.9
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10
115
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9
18
30
1.82
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17
1.9
17
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25
2
5
65
1.28
19573672--19573728
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1.9
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7
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1.50
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0
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0
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14
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25
0
14
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34
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15
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1.75
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2.1
13
100
0
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0
0
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3.0
126
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1
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15
38
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3.1
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41
19
2
37
1.63
19583369--19583444
34
2.2
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39
14
2
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1.59
19583511--19583580
35
2.0
34
86
8
97
41
21
0
37
1.53
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
19583514--19583596
34
2.4
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0
38
1.48
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3.8
27
78
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28
6
0
66
1.15
19588969--19589012
22
2.0
22
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34
4
0
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1.16
19588910--19589022
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28
6
0
65
1.16
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2.0
55
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0
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2.0
43
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0
158
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19591008--19591080
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1.95
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26
19
1.94
19603519--19603642
63
2.0
63
91
0
203
36
17
9
36
1.83

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349