Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A01
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  115637255

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  345  of  349  ( 41854 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.0
213
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1.79
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Percent
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Percent
Indels
Score
A
C
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T
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1.12
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
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2.0
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2.1
22
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11
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0
25
29
1.53
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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13
210
21
21
27
28
1.99
113894623--113894793
93
1.8
93
96
0
315
21
21
28
28
1.99
113896606--113896638
17
1.9
17
100
0
66
24
21
12
42
1.86
113896637--113896719
31
2.7
31
92
0
130
37
3
24
34
1.73
113896957--113897050
47
2.0
47
93
0
161
29
24
25
20
1.99
113898085--113898190
34
3.1
34
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10
126
24
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33
19
1.97
113898582--113898607
12
2.2
12
100
0
52
38
7
11
42
1.70
113903533--113903577
21
2.1
21
83
0
54
44
15
20
20
1.87
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23
2.0
23
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17
17
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113924393--113924465
5
13.8
5
81
9
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20
2
0
76
0.90
113924392--113924465
30
2.5
30
89
6
107
20
4
0
75
0.96
113924571--113924669
42
2.4
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0
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28
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13
27
1.94
113925808--113925838
9
3.3
9
91
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80
0
0
19
0.71
113925808--113925838
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80
0
0
19
0.71
113925808--113925849
19
2.2
19
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0
57
80
0
4
14
0.86
113930931--113930974
21
2.1
21
100
0
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1.9
44
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0
150
36
21
11
29
1.89
113935441--113935485
23
2.0
23
81
0
54
57
2
2
37
1.23
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.8
12
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4
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67
0
0
32
0.91
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19
2.5
20
90
3
75
38
2
10
50
1.48
113947732--113947771
17
2.4
17
87
4
55
52
2
2
42
1.28
113957801--113957842
18
2.2
20
87
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33
21
2
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1.66
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0
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0
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0
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15
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15
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10
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19
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2.0
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2.0
22
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0
2
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1.10
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2.1
29
100
0
120
20
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6
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1.75
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28
2.0
29
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37
1.80
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11
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0
16
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1.18
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26
2.5
26
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5
85
42
14
10
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1.80
113998205--113998250
22
2.1
22
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19
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4
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1.20
113998211--113998258
22
2.2
22
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27
4
4
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1.30
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25
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0
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0
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100
0
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21
0
0.75
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21
3.2
20
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6
78
60
1
4
33
1.26
114016053--114016133
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2.0
41
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7
101
62
2
4
29
1.29
114016216--114016253
19
2.0
19
89
0
58
50
5
5
39
1.48
114016216--114016281
20
3.3
20
80
2
71
46
3
3
46
1.33
114016450--114016493
22
2.0
23
81
4
54
31
2
9
56
1.43
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
114016754--114016828
36
2.1
36
94
0
132
34
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8
41
1.77
114018309--114018347
14
2.9
13
80
3
51
48
2
0
48
1.15
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2.1
17
100
0
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1.89
114031910--114031935
12
2.2
12
100
0
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114036709--114036737
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37
0
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114047479--114047503
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0
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0
0
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0.40
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2.0
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3.5
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2
52
1.38
114054983--114055073
25
3.8
24
79
17
109
41
5
2
50
1.37

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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